Fragment-based serach for TIGIT inhibitors

licenciate
dc.abstract.enTIGIT is an immunoreceptor expressed on lymphocytes and has been studied in the context of cancer. Until now it has been known that TIGIT is involved in tumor cells' ability to evade immune responses directed against them. TIGIT’s natural ligands, expressed on the surface of the cancer cells, are CD155, CD112 and to a lesser extent PVRL3. The first two ligands, when interacting with TIGIT, suppress immune response, but in the absence of TIGIT they bind to the CD226 receptor which promotes the activation of the immune response against the tumor cells. Therefore targeting TIGIT with small molecule inhibitors may form the basis on novel cancer immunotherapy. In this research, an attempt was made to find low molecular weight compounds (Mw≤300) showing binding to TIGIT to form a basis for the identification of the TIGIT-CD155 and TIGIT-CD112 interaction inhibitors. For this purpose, 183 compounds deposited in the library of the Chemical Biology and Drug Design Group, were evaluated in thermal shift assay (TSA). Subsequently hits from TSA were validated using heteronuclear single quantum coherence spectroscopy (1H-15N HSQC). As a result of the TSA, 21 chemical compounds were accepted as hits, after validation by the 1H-15N HSQC method no compound was confirmed to bind to the TIGIT. The search for a low molecular weight compound binding to the TIGIT protein should be continued in order to find one.pl
dc.abstract.plTIGIT jest immunoreceptorem ekspresjonowanym na limfocytach i był badany w kontekście raka. Do tej pory wiadomo było, że TIGIT jest zaangażowany w zdolność komórek nowotworowych do ukrywania się przed skierowaną przeciwko nim odpowiedzią immunologiczną. Naturalnymi ligandami TIGIT, ekspresjonowanymi na powierzchni komórek nowotworowych, są CD155, CD112 oraz w mniejszym stopniu PVRL3. Pierwsze dwa ligandy, wchodząc w interakcję z TIGIT, hamują odpowiedź immunologiczną, ale w przypadku braku TIGIT w ich otoczeniu wiążą się z receptorem CD226, który promuje aktywację odpowiedzi immunologicznej przeciwko komórkom nowotworowym. Dlatego celowanie w TIGIT za pomocą inhibitorów drobnocząsteczkowych może stanowić podstawę nowej immunoterapii nowotworów. W tych badaniach podjęto próbę znalezienia związków o niskiej masie cząsteczkowej (Mw≤300) wykazujących wiązanie z TIGIT, aby stworzyć podstawę do identyfikacji inhibitorów oddziaływań TIGIT-CD155 i TIGIT-CD112. W tym celu w teście przesunięcia termicznego (TSA) przebadano 183 związki zdeponowane w bibliotece Zespołu Biologii Chemicznej i Projektowania Nowych Leków. Następnie trafienia z TSA zostały zweryfikowane za pomocą heterojądrowej pojedynczej spektroskopii koherencji kwantowej (1H-15N HSQC). W wyniku TSA, 21 związków chemicznych zostało zaakceptowanych jako trafienia, po walidacji metodą 1H-15N HSQC nie potwierdzono wiązania żadnego związku z TIGIT. Poszukiwania związku o niskiej masie cząsteczkowej wiążącego się z białkiem TIGIT należy kontynuować w celu jego znalezienia.pl
dc.affiliationWydział Chemiipl
dc.areaobszar nauk ścisłychpl
dc.contributor.advisorKitel, Radosławpl
dc.contributor.authorKowalczyk, Michałpl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WC3pl
dc.contributor.reviewerKitel, Radosławpl
dc.contributor.reviewerKalinowska-Tłuścik, Justyna - 128600 pl
dc.date.accessioned2022-06-09T21:31:54Z
dc.date.available2022-06-09T21:31:54Z
dc.date.submitted2021-09-13pl
dc.fieldofstudychemia medycznapl
dc.identifier.apddiploma-148045-262388pl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/292904
dc.languageengpl
dc.subject.enTIGIT; Cancer; Fragment based drug designpl
dc.subject.plTIGIT; Nowotworzenie; Projektowanie leków oparte na fragmentachpl
dc.titleFragment-based serach for TIGIT inhibitorspl
dc.title.alternativeFragment-based search for TIGIT inhibitorspl
dc.typelicenciatepl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
TIGIT is an immunoreceptor expressed on lymphocytes and has been studied in the context of cancer. Until now it has been known that TIGIT is involved in tumor cells' ability to evade immune responses directed against them. TIGIT’s natural ligands, expressed on the surface of the cancer cells, are CD155, CD112 and to a lesser extent PVRL3. The first two ligands, when interacting with TIGIT, suppress immune response, but in the absence of TIGIT they bind to the CD226 receptor which promotes the activation of the immune response against the tumor cells. Therefore targeting TIGIT with small molecule inhibitors may form the basis on novel cancer immunotherapy. In this research, an attempt was made to find low molecular weight compounds (Mw≤300) showing binding to TIGIT to form a basis for the identification of the TIGIT-CD155 and TIGIT-CD112 interaction inhibitors. For this purpose, 183 compounds deposited in the library of the Chemical Biology and Drug Design Group, were evaluated in thermal shift assay (TSA). Subsequently hits from TSA were validated using heteronuclear single quantum coherence spectroscopy (1H-15N HSQC). As a result of the TSA, 21 chemical compounds were accepted as hits, after validation by the 1H-15N HSQC method no compound was confirmed to bind to the TIGIT. The search for a low molecular weight compound binding to the TIGIT protein should be continued in order to find one.
dc.abstract.plpl
TIGIT jest immunoreceptorem ekspresjonowanym na limfocytach i był badany w kontekście raka. Do tej pory wiadomo było, że TIGIT jest zaangażowany w zdolność komórek nowotworowych do ukrywania się przed skierowaną przeciwko nim odpowiedzią immunologiczną. Naturalnymi ligandami TIGIT, ekspresjonowanymi na powierzchni komórek nowotworowych, są CD155, CD112 oraz w mniejszym stopniu PVRL3. Pierwsze dwa ligandy, wchodząc w interakcję z TIGIT, hamują odpowiedź immunologiczną, ale w przypadku braku TIGIT w ich otoczeniu wiążą się z receptorem CD226, który promuje aktywację odpowiedzi immunologicznej przeciwko komórkom nowotworowym. Dlatego celowanie w TIGIT za pomocą inhibitorów drobnocząsteczkowych może stanowić podstawę nowej immunoterapii nowotworów. W tych badaniach podjęto próbę znalezienia związków o niskiej masie cząsteczkowej (Mw≤300) wykazujących wiązanie z TIGIT, aby stworzyć podstawę do identyfikacji inhibitorów oddziaływań TIGIT-CD155 i TIGIT-CD112. W tym celu w teście przesunięcia termicznego (TSA) przebadano 183 związki zdeponowane w bibliotece Zespołu Biologii Chemicznej i Projektowania Nowych Leków. Następnie trafienia z TSA zostały zweryfikowane za pomocą heterojądrowej pojedynczej spektroskopii koherencji kwantowej (1H-15N HSQC). W wyniku TSA, 21 związków chemicznych zostało zaakceptowanych jako trafienia, po walidacji metodą 1H-15N HSQC nie potwierdzono wiązania żadnego związku z TIGIT. Poszukiwania związku o niskiej masie cząsteczkowej wiążącego się z białkiem TIGIT należy kontynuować w celu jego znalezienia.
dc.affiliationpl
Wydział Chemii
dc.areapl
obszar nauk ścisłych
dc.contributor.advisorpl
Kitel, Radosław
dc.contributor.authorpl
Kowalczyk, Michał
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WC3
dc.contributor.reviewerpl
Kitel, Radosław
dc.contributor.reviewerpl
Kalinowska-Tłuścik, Justyna - 128600
dc.date.accessioned
2022-06-09T21:31:54Z
dc.date.available
2022-06-09T21:31:54Z
dc.date.submittedpl
2021-09-13
dc.fieldofstudypl
chemia medyczna
dc.identifier.apdpl
diploma-148045-262388
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/292904
dc.languagepl
eng
dc.subject.enpl
TIGIT; Cancer; Fragment based drug design
dc.subject.plpl
TIGIT; Nowotworzenie; Projektowanie leków oparte na fragmentach
dc.titlepl
Fragment-based serach for TIGIT inhibitors
dc.title.alternativepl
Fragment-based search for TIGIT inhibitors
dc.typepl
licenciate
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
23
Views per month
Views per city
Krakow
5
Tel Aviv
3
Dublin
2
Warsaw
2
Wroclaw
2
Lodz
1
London
1
Richardson
1
Wejherowo
1

No access

No Thumbnail Available