Simple view
Full metadata view
Authors
Statistics
Porównanie profilu ekspresji wybranych genów w skórze u myszy MCPIP-1CKO oraz MCPIP-1WT
Comparison of the expression profile of the selected genes in the skin of mice MCPIP1CKO and MCPIP1WT
MCPIP1, MCPIP1EKO, Regnaza-1, skóra, naskórek, skóra właściwa, myszy, keratynocyty, qRT-PCR, RNA-seq, profilowanie transkryptomiczne, profil ekspresji genów, regulacja ekspresji genów, Zc3h12a, Lcn2, Slc6a14, Stfa3, Fabp5, Prss27, Slc16a6, Ciart, Bcat1
MCPIP1, MCPIP1EKO skin, epidermis, dermis, mice, qRT-PCR, RNA-seq, gene expression profile, transcriptome sequencing, keratinocytes, regulation of gene expression, Regnase-1, Zc3h12a, Lcn2, Slc6a14, Stfa3, Fabp5, Prss27, Slc16a6, Ciart, Bcat1
RNaza MCPIP1 dzięki swojemu szerokiemu spektrum działania uczestniczy w wielu procesach biologicznych. Jego główną funkcją jest regulacja stanów zapalnych przez degradację transkryptów wielu cytokin prozapalnych tj IL-1β oraz IL-6. Stan zapalny może również regulować poprzez hamowanie aktywacji czynnika transkrypcyjnego NFκB- kluczowego aktywatora stanu zapalnego. Rolę Regnzazy-1 potwierdzono także w różnicowaniu komórek, rozwoju nowotworów, adipogenezie, angiogenezie oraz w odpowiedzi przeciwwirusowej. W niniejszej pracy przeprowadzono ewaluację wyników analiz transkryptomicznych za pomocą metody qRT-PCR oraz analizowano wpływ białka MCPIP1 na poziom ekspresji wybranych genów w skórze u myszy w różnym wieku z warunkowym nokautem genu Zc3h12a w keratynocytach.
MCPIP1 has a broad spectrum of biological activity. Main function of this protein is the regulation of inflammation through the degradation of the pro-inflammatory cytokine transcripts: IL-1β and IL-6. Inflammation can be also regulated by inhibiting of the NFκB transcription factor, a pivotal activator of inflammation. The role of Regnase-1 has also been confirmed in the cell differentiation, tumor development, adipogenesis, angiogenesis and in the antivirus response. The aim of this thesis is verification of transcriptomic analyzes (RNA-seq) using the qRT-PCR technique. The analysis was extended by a different age group, and the epidermis and dermis from different locations of the mice skin MCPIP1EKO vs. MCPIP1WT.
| dc.abstract.en | MCPIP1 has a broad spectrum of biological activity. Main function of this protein is the regulation of inflammation through the degradation of the pro-inflammatory cytokine transcripts: IL-1β and IL-6. Inflammation can be also regulated by inhibiting of the NFκB transcription factor, a pivotal activator of inflammation. The role of Regnase-1 has also been confirmed in the cell differentiation, tumor development, adipogenesis, angiogenesis and in the antivirus response. The aim of this thesis is verification of transcriptomic analyzes (RNA-seq) using the qRT-PCR technique. The analysis was extended by a different age group, and the epidermis and dermis from different locations of the mice skin MCPIP1EKO vs. MCPIP1WT. | pl |
| dc.abstract.pl | RNaza MCPIP1 dzięki swojemu szerokiemu spektrum działania uczestniczy w wielu procesach biologicznych. Jego główną funkcją jest regulacja stanów zapalnych przez degradację transkryptów wielu cytokin prozapalnych tj IL-1β oraz IL-6. Stan zapalny może również regulować poprzez hamowanie aktywacji czynnika transkrypcyjnego NFκB- kluczowego aktywatora stanu zapalnego. Rolę Regnzazy-1 potwierdzono także w różnicowaniu komórek, rozwoju nowotworów, adipogenezie, angiogenezie oraz w odpowiedzi przeciwwirusowej. W niniejszej pracy przeprowadzono ewaluację wyników analiz transkryptomicznych za pomocą metody qRT-PCR oraz analizowano wpływ białka MCPIP1 na poziom ekspresji wybranych genów w skórze u myszy w różnym wieku z warunkowym nokautem genu Zc3h12a w keratynocytach. | pl |
| dc.affiliation | Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii | pl |
| dc.area | obszar nauk przyrodniczych | pl |
| dc.contributor.advisor | Kwitniewski, Mateusz | pl |
| dc.contributor.author | Pocałuń, Natalia | pl |
| dc.contributor.departmentbycode | UJK/WBBB | pl |
| dc.contributor.reviewer | Kwitniewski, Mateusz | pl |
| dc.contributor.reviewer | Łoboda, Agnieszka - 130081 | pl |
| dc.date.accessioned | 2021-12-08T22:34:55Z | |
| dc.date.available | 2021-12-08T22:34:55Z | |
| dc.date.submitted | 2021-07-23 | pl |
| dc.fieldofstudy | biofizyka | pl |
| dc.identifier.apd | diploma-153122-227310 | pl |
| dc.identifier.uri | https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/284947 | |
| dc.language | pol | pl |
| dc.subject.en | MCPIP1, MCPIP1EKO skin, epidermis, dermis, mice, qRT-PCR, RNA-seq, gene expression profile, transcriptome sequencing, keratinocytes, regulation of gene expression, Regnase-1, Zc3h12a, Lcn2, Slc6a14, Stfa3, Fabp5, Prss27, Slc16a6, Ciart, Bcat1 | pl |
| dc.subject.pl | MCPIP1, MCPIP1EKO, Regnaza-1, skóra, naskórek, skóra właściwa, myszy, keratynocyty, qRT-PCR, RNA-seq, profilowanie transkryptomiczne, profil ekspresji genów, regulacja ekspresji genów, Zc3h12a, Lcn2, Slc6a14, Stfa3, Fabp5, Prss27, Slc16a6, Ciart, Bcat1 | pl |
| dc.title | Porównanie profilu ekspresji wybranych genów w skórze u myszy MCPIP-1CKO oraz MCPIP-1WT | pl |
| dc.title.alternative | Comparison of the expression profile of the selected genes in the skin of mice MCPIP1CKO and MCPIP1WT | pl |
| dc.type | master | pl |
| dspace.entity.type | Publication |