Historia Żydów w nowożytnej Japonii rozpoczyna się w drugiej połowie XIX w. Wówczas mamy do czynienia z pierwszym osadnictwem wyznawców judaizmu w Nagasaki i Jokohamie. Na początku XX w. istotnym wydarzeniem była wojna rosyjsko-japońska (1904-1905). Położyła ona kres istnieniu gminy żydowskiej w Nagasaki. Japonia jako przeciwnik Rosji była wspierana przez bogatych Żydów. Rewolucja bolszewicka w Rosji (1917) była źródłem antysemickiej literatury w Japonii w latach 20., nie miała ona jednak istotnego wpływu na społeczeństwo japońskie. W pierwszej połowie XX w. rozwija się przede wszystkim gmina żydowska w Kobe oraz Tokio. Społeczność w Kobe uległa powiększeniu przede po trzęsieniu ziemi w Tokio w 1923 roku. Od 1932 roku Japonia rozpoczęła ekspansję terytorialną na Dalekim Wschodzie. Pod jej panowaniem znalazły się gminy żydowskie w Chinach, takie jak Harbin i Szanghaj. Podczas II wojny światowej Japonia stanowiła kraj tranzytowy dla uchodźców, a najwięcej z nich przebywało w Kobe. Z powodu sojuszu z III Rzeszą, w latach wojny w Japonii nasiliła się propaganda antysemicka. Żydzi w Szanghaju zostali umieszczeni w getcie, podobnie jak inni uchodźcy i tysiące Chińczyków. Japonia nigdy nie zamierzała eksterminować Żydów. Po II wojnie światowej Japonia dostała się pod okupację amerykańską, z gen. MacArthurem na czele. Kilku Amerykanów pochodzenia żydowskiego przyczyniło się do wprowadzenia reform w powojennej Japonii. Po zakończeniu okupacji głównym ośrodkiem życia żydowskiego stało się Tokio. Od lat 50. do 80. stosunki dyplomatyczne Japonii z Izraelem były niepewne, ze względu na relacje krajami arabskimi. W tym samym czasie jednak zainteresowanie Japończyków judaizmem wzrasta, zwłaszcza w w sektach chrześcijańskich. Japonistyka na Uniwersytecie Hebrajskim w Jerozolimie rozwija się do dziś. W Japonii powojennej konwersje na judaizm zdarzały się rzadko. Najsłynniejszym konwertytą był Abraham Setsuzo Kotsuji.

The history of the Jews in modern Japan begins in second half of 19th century. Back then first Jews settled in Nagasaki and Yokohama. In the early 20th century a crucial event was russo-japanese war(1904-1905). This war put Jewish community in Nagasaki to an end. Japan as a Russia's opponent was supported by rich Jews. Bolshevik Revolution was an inspiration for antisemitic literature in Japan in 1920', though its influence on Japanese society was irrelevant. In the first half of 20th century most active Jewish community was in Kobe and also in Tokyo. Jewish community in Kobe enlarged after earthquake in Tokyo in 1923. In 1932 Japan started its expansion in the Far East. Jewish communities in China, such as Shanghai and Harbin, found themselves under japanese occupation. During World War II Japan was a transit state for refugees and most of them came to Kobe. Because of the allience between Japan and Germany during the war, antisemitic propaganda in Japan aroused. Jews in Shanghai were transferred into ghetto, so were other refugees and thousands of Chinese. Japan never planned to exterminate Jews though. After World War II was occupied by USA and Mac Arthur was a commander. Some Americans with Jewish origin helped MacArthur implement reforms in postwar Japan. After occupation Tokyo beacame a center of Jewish life in Japan. Between 1950' and 80' diplomatic relations between Japan and Israel were uneasy because of the relations with arabic countries. Simultaneously Japanese interest in Judaism increased, especially among christian sects. Japanese studies at Hebrew University in Jerusalem has been developed until today. In Japan conversions to Judaism rarely took place. The most famous convert was Abraham Setsuzo Kotsuji.