Wpływ sialylacji Fc gamma RIIIa na wiązanie przeciwciał- studia in vitro oraz in silico

Influence of Fc gamma RIIIa sialylation on antibodies

master
dc.abstract.enLow affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor IIIa is a member of the Fc gamma receptor family which binds, with low affinity, the Fc part of human immunoglobulin G (IgG Fc). Fc gamma RIIIa is expressed in Natural Killer cells (NK cells), macrophages and polymorphonuclear leukocytes (PMN). It is involved in phagocytosis, secretion of enzymes and inflammatory mediators, antibodydependent cytotoxicity (ADCC) and clearance of immune complexes. As a glycoprotein Fc gamma RIIIa bears four N-linked oligosaccharides. The most important sugar residue among them is glycan at the N-162 position. It was proved that removal of this carbohydrate increased binding activity. What is more, glycans on Fc gamma RIIIa are highly sialylated.In this study the contribution of sialic acid of FcgRIIIa to the strength of the Fc gamma RIIIa-IgG1 complex was analyzed both in vitro and in silico. Using surface plasmon resonance we observed that removal of sialic acid from carbohydrates improved binding kinetics in phosphate buffer. Furthermore, whole process was driven by increase of association rate constant. We conclude that affinity between antibody and Fc gamma RIIIa during the first few seconds is mediated by long distant electrostatic forces. Changing the overall charge of Fc gamma RIIIa, desialylation increases interactions. Molecular dynamics simulation allowed usto identify the most important residues involved in interaction what explained, in atomic details, possible binding mechanism.pl
dc.abstract.plReceptor A dla fragmentu Fc przeciwciał klasy IgG o niskim powinowactwie (Fc gamma RIIIa) należy do rodziny receptorów, które wiążą fragment Fc przeciwciał klasy IgG (IgG Fc). Fc gamma RIIIa jest ekspresjonowany w komórkach NK, makrofagach oraz granulocytach. Bierze udział w takich procesach jak fagocytoza, wydzielanie enzymów oraz cząsteczek prozapalnych, cytotoksyczność komórkowa zależna od przeciwciał czy czyszczenie kompleksów immunologicznych. Jako glikoproteina Fc gamma RIIIa na swej powierzchni posiada czteryzłożone cukry. Najważniejszy z pośród nich jest cukier w pozycji N-162. Wykazano,że usunięcie tego cukru powoduje wzrost powinowactwa receptora do przeciwciała. Co więcej, cukry na Fc gamma RIIIa są wysoce sjalylowane.W niniejszej pracy zbadano wpływ kwasu sjalowego obecnego na cukrach Fc gamma RIIIa na wiązanie przeciwciał, zarówno in vitro jak i in silico. Używając powierzchniowego rezonansu plazmonowego zaobserwowano, że usunięcie kwasu sjalowego z cukrów spowodowało wzrost powinowactwa receptora do monoklonalnego przeciwciała klasy IgG1. Co więcej, cały proces był sterowany poprzez stałą asocjacji. Z tego wynika, że powinowactwo między białkami w pierwszych sekundach jest kierowane przez dalekozasięgowe siły elektrostatyczne. Zmieniając całościowy ładunek białka, kwas sjalowy powoduje osłabienie wiązania. Z kolei, symulacja dynamiki molekularnej pozwoliła zidentyfikować reszty pełniące kluczową rolę w oddziaływaniu między tymi białkami oraz wyjaśniła, w szczegółach atomowych, możliwy mechanizm reakcji.pl
dc.affiliationWydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologiipl
dc.areaobszar nauk przyrodniczychpl
dc.contributor.advisorPasenkiewicz-Gierula, Marta - 131288 pl
dc.contributor.authorGumienny, Rafałpl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WBBBpl
dc.contributor.reviewerKędracka-Krok, Sylwia - 128739 pl
dc.contributor.reviewerPasenkiewicz-Gierula, Marta - 131288 pl
dc.date.accessioned2020-07-14T21:00:24Z
dc.date.available2020-07-14T21:00:24Z
dc.date.submitted2011-06-20pl
dc.fieldofstudybiotechnologiapl
dc.identifier.apddiploma-56611-61132pl
dc.identifier.projectAPD / Opl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/171024
dc.languageengpl
dc.subject.enFc gamma RIIIa, sialic acid, glycosylationpl
dc.subject.plFc gamma RIIIa, kwas sjalowy, glikozylacjapl
dc.titleWpływ sialylacji Fc gamma RIIIa na wiązanie przeciwciał- studia in vitro oraz in silicopl
dc.titleInfluence of Fc gamma RIIIa sialylation on antibodiespl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor IIIa is a member of the Fc gamma receptor family which binds, with low affinity, the Fc part of human immunoglobulin G (IgG Fc). Fc gamma RIIIa is expressed in Natural Killer cells (NK cells), macrophages and polymorphonuclear leukocytes (PMN). It is involved in phagocytosis, secretion of enzymes and inflammatory mediators, antibodydependent cytotoxicity (ADCC) and clearance of immune complexes. As a glycoprotein Fc gamma RIIIa bears four N-linked oligosaccharides. The most important sugar residue among them is glycan at the N-162 position. It was proved that removal of this carbohydrate increased binding activity. What is more, glycans on Fc gamma RIIIa are highly sialylated.In this study the contribution of sialic acid of FcgRIIIa to the strength of the Fc gamma RIIIa-IgG1 complex was analyzed both in vitro and in silico. Using surface plasmon resonance we observed that removal of sialic acid from carbohydrates improved binding kinetics in phosphate buffer. Furthermore, whole process was driven by increase of association rate constant. We conclude that affinity between antibody and Fc gamma RIIIa during the first few seconds is mediated by long distant electrostatic forces. Changing the overall charge of Fc gamma RIIIa, desialylation increases interactions. Molecular dynamics simulation allowed usto identify the most important residues involved in interaction what explained, in atomic details, possible binding mechanism.
dc.abstract.plpl
Receptor A dla fragmentu Fc przeciwciał klasy IgG o niskim powinowactwie (Fc gamma RIIIa) należy do rodziny receptorów, które wiążą fragment Fc przeciwciał klasy IgG (IgG Fc). Fc gamma RIIIa jest ekspresjonowany w komórkach NK, makrofagach oraz granulocytach. Bierze udział w takich procesach jak fagocytoza, wydzielanie enzymów oraz cząsteczek prozapalnych, cytotoksyczność komórkowa zależna od przeciwciał czy czyszczenie kompleksów immunologicznych. Jako glikoproteina Fc gamma RIIIa na swej powierzchni posiada czteryzłożone cukry. Najważniejszy z pośród nich jest cukier w pozycji N-162. Wykazano,że usunięcie tego cukru powoduje wzrost powinowactwa receptora do przeciwciała. Co więcej, cukry na Fc gamma RIIIa są wysoce sjalylowane.W niniejszej pracy zbadano wpływ kwasu sjalowego obecnego na cukrach Fc gamma RIIIa na wiązanie przeciwciał, zarówno in vitro jak i in silico. Używając powierzchniowego rezonansu plazmonowego zaobserwowano, że usunięcie kwasu sjalowego z cukrów spowodowało wzrost powinowactwa receptora do monoklonalnego przeciwciała klasy IgG1. Co więcej, cały proces był sterowany poprzez stałą asocjacji. Z tego wynika, że powinowactwo między białkami w pierwszych sekundach jest kierowane przez dalekozasięgowe siły elektrostatyczne. Zmieniając całościowy ładunek białka, kwas sjalowy powoduje osłabienie wiązania. Z kolei, symulacja dynamiki molekularnej pozwoliła zidentyfikować reszty pełniące kluczową rolę w oddziaływaniu między tymi białkami oraz wyjaśniła, w szczegółach atomowych, możliwy mechanizm reakcji.
dc.affiliationpl
Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
dc.areapl
obszar nauk przyrodniczych
dc.contributor.advisorpl
Pasenkiewicz-Gierula, Marta - 131288
dc.contributor.authorpl
Gumienny, Rafał
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WBBB
dc.contributor.reviewerpl
Kędracka-Krok, Sylwia - 128739
dc.contributor.reviewerpl
Pasenkiewicz-Gierula, Marta - 131288
dc.date.accessioned
2020-07-14T21:00:24Z
dc.date.available
2020-07-14T21:00:24Z
dc.date.submittedpl
2011-06-20
dc.fieldofstudypl
biotechnologia
dc.identifier.apdpl
diploma-56611-61132
dc.identifier.projectpl
APD / O
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/171024
dc.languagepl
eng
dc.subject.enpl
Fc gamma RIIIa, sialic acid, glycosylation
dc.subject.plpl
Fc gamma RIIIa, kwas sjalowy, glikozylacja
dc.titlepl
Wpływ sialylacji Fc gamma RIIIa na wiązanie przeciwciał- studia in vitro oraz in silico
dc.titlepl
Influence of Fc gamma RIIIa sialylation on antibodies
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
12
Views per month
Views per city
Dublin
3
Wroclaw
2
Katowice
1
Krakow
1
Warsaw
1

No access

No Thumbnail Available