Simple view

Full metadata view

Authors

Statistics

Comprehensive functional annotation of metagenomes and microbial genomes using a deep learning-based method

2023
journal article
article
10.1128/msystems.01178-22
Journal
mSystems
140
Author
Maranga Mary

Szczerbiak Paweł

Bezshapkin Valentyn

Gligorijevic Vladimir

Chandler Chris
Show more
Volume
8
Number
2
Article ID
e01178-22
eISSN
2379-5077
Keywords in English

genome

metagenome

orthology

pangenome

deep learning

functional annotation

gene function

metagenome-assembled genomes

metagenomics

microbiome

Remarks

Online First 2023-04-03

Language
English
Journal language
English
Affiliation
Pion Prorektora ds. badań naukowych : Małopolskie Centrum BiotechnologiiSzkoła Doktorska Nauk Ścisłych i Przyrodniczych
Scopus© citations
21
dc.affiliationPion Prorektora ds. badań naukowych : Małopolskie Centrum Biotechnologiipl
dc.affiliationSzkoła Doktorska Nauk Ścisłych i Przyrodniczychpl
dc.contributor.authorMaranga, Mary - 425875 pl
dc.contributor.authorSzczerbiak, Paweł - 426845 pl
dc.contributor.authorBezshapkin, Valentyn - 256709 pl
dc.contributor.authorGligorijevic, Vladimirpl
dc.contributor.authorChandler, Chrispl
dc.contributor.authorBonneau, Richardpl
dc.contributor.authorXavier, Ramnik J.pl
dc.contributor.authorVatanen, Tommipl
dc.contributor.authorKościółek, Tomasz - 106890 pl
dc.date.accessioned2023-04-26T09:42:01Z
dc.date.available2023-04-26T09:42:01Z
dc.date.issued2023pl
dc.date.openaccess0
dc.description.accesstimew momencie opublikowania
dc.description.additionalOnline First 2023-04-03pl
dc.description.number2pl
dc.description.versionostateczna wersja wydawcy
dc.description.volume8pl
dc.identifier.articleide01178-22pl
dc.identifier.doi10.1128/msystems.01178-22pl
dc.identifier.eissn2379-5077pl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/310839
dc.languageengpl
dc.language.containerengpl
dc.rightsUdzielam licencji. Uznanie autorstwa 4.0 Międzynarodowa*
dc.rights.licenceCC-BY
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.pl*
dc.share.typeotwarte czasopismo
dc.subject.engenomepl
dc.subject.enmetagenomepl
dc.subject.enorthologypl
dc.subject.enpangenomepl
dc.subject.endeep learningpl
dc.subject.enfunctional annotationpl
dc.subject.engene functionpl
dc.subject.enmetagenome-assembled genomespl
dc.subject.enmetagenomicspl
dc.subject.enmicrobiomepl
dc.subtypeArticlepl
dc.titleComprehensive functional annotation of metagenomes and microbial genomes using a deep learning-based methodpl
dc.title.journalmSystemspl
dc.typeJournalArticlepl
dspace.entity.typePublication
dc.affiliationpl
Pion Prorektora ds. badań naukowych : Małopolskie Centrum Biotechnologii
dc.affiliationpl
Szkoła Doktorska Nauk Ścisłych i Przyrodniczych
dc.contributor.authorpl
Maranga, Mary - 425875
dc.contributor.authorpl
Szczerbiak, Paweł - 426845
dc.contributor.authorpl
Bezshapkin, Valentyn - 256709
dc.contributor.authorpl
Gligorijevic, Vladimir
dc.contributor.authorpl
Chandler, Chris
dc.contributor.authorpl
Bonneau, Richard
dc.contributor.authorpl
Xavier, Ramnik J.
dc.contributor.authorpl
Vatanen, Tommi
dc.contributor.authorpl
Kościółek, Tomasz - 106890
dc.date.accessioned
2023-04-26T09:42:01Z
dc.date.available
2023-04-26T09:42:01Z
dc.date.issuedpl
2023
dc.date.openaccess
0
dc.description.accesstime
w momencie opublikowania
dc.description.additionalpl
Online First 2023-04-03
dc.description.numberpl
2
dc.description.version
ostateczna wersja wydawcy
dc.description.volumepl
8
dc.identifier.articleidpl
e01178-22
dc.identifier.doipl
10.1128/msystems.01178-22
dc.identifier.eissnpl
2379-5077
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/310839
dc.languagepl
eng
dc.language.containerpl
eng
dc.rights*
Udzielam licencji. Uznanie autorstwa 4.0 Międzynarodowa
dc.rights.licence
CC-BY
dc.rights.uri*
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode.pl
dc.share.type
otwarte czasopismo
dc.subject.enpl
genome
dc.subject.enpl
metagenome
dc.subject.enpl
orthology
dc.subject.enpl
pangenome
dc.subject.enpl
deep learning
dc.subject.enpl
functional annotation
dc.subject.enpl
gene function
dc.subject.enpl
metagenome-assembled genomes
dc.subject.enpl
metagenomics
dc.subject.enpl
microbiome
dc.subtypepl
Article
dc.titlepl
Comprehensive functional annotation of metagenomes and microbial genomes using a deep learning-based method
dc.title.journalpl
mSystems
dc.typepl
JournalArticle
dspace.entity.type
Publication
Affiliations
Małopolskie Centrum Biotechnologii
Szczerbiak, Paweł
Kościółek, Tomasz
Maranga, Mary
Szkoła Doktorska Nauk Ścisłych i Przyrodniczych
Bezshapkin, Valentyn
No affiliation
Gligorijevic, Vladimir
Chandler, Chris
Bonneau, Richard
Xavier, Ramnik J.
Vatanen, Tommi

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
9
Views per month
Views per city
Krakow
3
Rytwiany
1
Downloads
maranga_et-al_comprehensive_functional_annotation_2023.pdf
16

Open Access

Thumbnail Image
License
CC-BY

Except as otherwise noted, this item is licensed under : Udzielam licencji. Uznanie autorstwa 4.0 Międzynarodowa

Collections
Research publications
Life sciences