Modification of plasmids necessary for substrate specifity research on the NS3 serine protease from the Zika virus

Celem przeprowadzonych badań było przeniesienie fragmentów DNA kodujących proteazę wirusa Zika wraz z kofaktorem NS2B-NS3WT, nieaktywną proteazę wirusa Zika wraz z kofaktorem NS2B-NS3S135A, aktywną proteazę wirusa Zika wraz z kofaktorem z dołączonym genem kodującym białko fluorescencyjne mCherry NS2B-NS3WT-mCherry oraz nieaktywną proteazę wirusa Zika wraz z kofaktorem z dołączonym genem kodującym białko fluorescencyjne mCherry NS2B-NS3S135A-mCherry z plazmidu pcDNA3.1 do plazmidu pBudCE4.1. Stworzenie opisanych plazmidów jest niezbędne do badania specyficzności substratowej proteazy serynowej NS2B-NS3WT wirusa Zika oraz umożliwi stworzenie modelu do analizy inhibitorów. W wyniku przeprowadzonego eksperymentu udało się otrzymać konstrukty NS2B-NS3WT-mCherry oraz NS2B-NS3S135A -mCherry.

The research objective was the transfer of DNA fragments coding the Zika virus protease with cofactor NS2B-NS3WT, the Zika virus inactive protease with cofactor NS2B-NS3S135A , the Zika virus active protease with a cofactor with the joined gene coding mCherry fluorescent protein NS2B-NS3WT-mCherry and the Zika virus inactive protease with a cofactor with the joined gene coding mCherry fluorescent protein NS2B-NS3S135A-mCherry from pcDNA3.1 plasmid to pBudCE4.1 plasmid. The formation of the plasmids described is necessary to research the Zika virus NS2B-NS3WT serine protease substrate specificity and shall enable the development of the model for inhibitors’ analysis. As a result of the experiment conducted NS2B-NS3WT-mCherry and NS2B-NS3S135A-mCherry constructs could be obtained.