Otrzymywanie i charakterystyka rekombinowanych lizostafin produkowanych naturalnie przez bakterie z gatunku Staphylococcus simulans i Staphylococcus pseudintermedius

master
dc.abstract.enLysostaphin produced by S. simulans is an antimicrobial enzyme, commonly used in laboratories to degrade staphylococci cell walls. Recently, a new lysostaphin produced by S. pseudintermedius was discovered in the Department of Analytical Biochemistry. This research presents efficiency comparison of purification methods used to obtain both proteins and shows differences between their activity. Production of lysostaphin S. simulans was performed according to the optimised protocol. Obtaining purified lysostaphin S. pseudintermedius required optimising of expression and protein purification conditions. Influence of different media, culture timescale and temperature on the efficiency of protein expression with respect to the amount of product formed was analysed. The influence of OD600 value when induction was performed, was also tested. Analyse of two different purification methods shows, that molecular filtration was ineffective, because of 35% loss in efficiency and about 2-fold decrease of activity. Enzymes activity and specificity was determined by the measurement of a rate of staphylococcal cells lysis incubated with the enzymes. Comparison of activity against four different staphylococci strains, revealed resistance of S. pseudintermedius 222 on produced lysostaphin.pl
dc.abstract.plLizostafina wytwarzana przez bakterie Staphylococcus simulans jest enzymem o działaniu antybakteryjnym, powszechnie wykorzystywanym w laboratoriach do degradacji ścian komórkowych gronkowców. Niedawno, w Zakładzie Biochemii Analitycznej została odkryta nowa lizostafina, produkowana przez S. pseudintermedius. Niniejsza praca skupia się na porównaniu wydajności oczyszczania obu białek i prezentuje różnice w ich aktywności. Produkcja lizostafiny S. simulans została przeprowadzona według wcześniej zoptymalizowanej procedury. Uzyskanie lizostafiny S. pseudintermedius wymagało optymalizacji warunków ekspresji i oczyszczania. Analizowano wpływ rodzaju stosownego podłoża, czasu i temperatury hodowli na wydajność produkcji białka w odniesieniu do ilości uzyskanego produktu we frakcji rozpuszczalnej. Sprawdzono również wpływ wartości OD600, przy którym dokonywano indukcji produkcji białka rekombinowanego. Analiza dwóch różnych metod oczyszczania białka wykazała, że sączenie molekularne było metodą nieefektywną ze względu na 35% spadek wydajności i prawie 2-krotne obniżenie aktywności. Aktywność i specyficzność lizostafin określano poprzez pomiar szybkości lizy komórek gronkowców inkubowanych z enzymem. Porównanie aktywności litycznej wobec czterech szczepów gronkowców, wykazało oporność szczepu S. Pseudintermedius 222 na produkowaną przez siebie lizostafinę.pl
dc.affiliationWydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologiipl
dc.areaobszar nauk przyrodniczychpl
dc.contributor.advisorWładyka, Benedykt - 132671 pl
dc.contributor.authorŻak, Karolinapl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WBBBpl
dc.contributor.reviewerWładyka, Benedykt - 132671 pl
dc.contributor.reviewerDubin, Grzegorz - 127778 pl
dc.date.accessioned2020-07-27T06:58:37Z
dc.date.available2020-07-27T06:58:37Z
dc.date.submitted2017-06-21pl
dc.fieldofstudybiotechnologia molekularnapl
dc.identifier.apddiploma-114555-199015pl
dc.identifier.projectAPD / Opl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/219922
dc.languagepolpl
dc.subject.enLysostaphin, Staphylococcus simulans, Staphylococcus pseudintermedius, bacteriocins, Ion exchange chromatography,pl
dc.subject.plLizostafina, Staphylococcus simulans, Staphylococcus pseudintermedius, bakteriocyny, Chromatografia jonowymiennapl
dc.titleOtrzymywanie i charakterystyka rekombinowanych lizostafin produkowanych naturalnie przez bakterie z gatunku Staphylococcus simulans i Staphylococcus pseudintermediuspl
dc.title.alternativeObtaining and characteristics of recombinant lysostaphins naturally produced by Staphylococcus simulans and Staphylococcus pseudintermediuspl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
Lysostaphin produced by S. simulans is an antimicrobial enzyme, commonly used in laboratories to degrade staphylococci cell walls. Recently, a new lysostaphin produced by S. pseudintermedius was discovered in the Department of Analytical Biochemistry. This research presents efficiency comparison of purification methods used to obtain both proteins and shows differences between their activity. Production of lysostaphin S. simulans was performed according to the optimised protocol. Obtaining purified lysostaphin S. pseudintermedius required optimising of expression and protein purification conditions. Influence of different media, culture timescale and temperature on the efficiency of protein expression with respect to the amount of product formed was analysed. The influence of OD600 value when induction was performed, was also tested. Analyse of two different purification methods shows, that molecular filtration was ineffective, because of 35% loss in efficiency and about 2-fold decrease of activity. Enzymes activity and specificity was determined by the measurement of a rate of staphylococcal cells lysis incubated with the enzymes. Comparison of activity against four different staphylococci strains, revealed resistance of S. pseudintermedius 222 on produced lysostaphin.
dc.abstract.plpl
Lizostafina wytwarzana przez bakterie Staphylococcus simulans jest enzymem o działaniu antybakteryjnym, powszechnie wykorzystywanym w laboratoriach do degradacji ścian komórkowych gronkowców. Niedawno, w Zakładzie Biochemii Analitycznej została odkryta nowa lizostafina, produkowana przez S. pseudintermedius. Niniejsza praca skupia się na porównaniu wydajności oczyszczania obu białek i prezentuje różnice w ich aktywności. Produkcja lizostafiny S. simulans została przeprowadzona według wcześniej zoptymalizowanej procedury. Uzyskanie lizostafiny S. pseudintermedius wymagało optymalizacji warunków ekspresji i oczyszczania. Analizowano wpływ rodzaju stosownego podłoża, czasu i temperatury hodowli na wydajność produkcji białka w odniesieniu do ilości uzyskanego produktu we frakcji rozpuszczalnej. Sprawdzono również wpływ wartości OD600, przy którym dokonywano indukcji produkcji białka rekombinowanego. Analiza dwóch różnych metod oczyszczania białka wykazała, że sączenie molekularne było metodą nieefektywną ze względu na 35% spadek wydajności i prawie 2-krotne obniżenie aktywności. Aktywność i specyficzność lizostafin określano poprzez pomiar szybkości lizy komórek gronkowców inkubowanych z enzymem. Porównanie aktywności litycznej wobec czterech szczepów gronkowców, wykazało oporność szczepu S. Pseudintermedius 222 na produkowaną przez siebie lizostafinę.
dc.affiliationpl
Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
dc.areapl
obszar nauk przyrodniczych
dc.contributor.advisorpl
Władyka, Benedykt - 132671
dc.contributor.authorpl
Żak, Karolina
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WBBB
dc.contributor.reviewerpl
Władyka, Benedykt - 132671
dc.contributor.reviewerpl
Dubin, Grzegorz - 127778
dc.date.accessioned
2020-07-27T06:58:37Z
dc.date.available
2020-07-27T06:58:37Z
dc.date.submittedpl
2017-06-21
dc.fieldofstudypl
biotechnologia molekularna
dc.identifier.apdpl
diploma-114555-199015
dc.identifier.projectpl
APD / O
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/219922
dc.languagepl
pol
dc.subject.enpl
Lysostaphin, Staphylococcus simulans, Staphylococcus pseudintermedius, bacteriocins, Ion exchange chromatography,
dc.subject.plpl
Lizostafina, Staphylococcus simulans, Staphylococcus pseudintermedius, bakteriocyny, Chromatografia jonowymienna
dc.titlepl
Otrzymywanie i charakterystyka rekombinowanych lizostafin produkowanych naturalnie przez bakterie z gatunku Staphylococcus simulans i Staphylococcus pseudintermedius
dc.title.alternativepl
Obtaining and characteristics of recombinant lysostaphins naturally produced by Staphylococcus simulans and Staphylococcus pseudintermedius
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
136
Views per month
Views per city
Krakow
28
Warsaw
15
Katowice
5
Bielsko-Biala
4
Iasi
4
Lodz
4
Wroclaw
4
Biała Podlaska
3
Olsztyn
3
Poznan
3

No access

No Thumbnail Available