Genotypic characterization od Candida species isolated from patients with suspected invasive fungal infection.

Celem pracy była ocena częstości występowania kolonizacji/ zakażeń grzybiczych u chorych hospitalizowanych w 2013 roku w wybranych oddziałach Szpitala Specjalistycznego im. Ludwika Rydygiera w Krakowie oraz określenie stopnia podobieństwa genetycznego wśród 22 szczepów grzybów z rodziny drożdżopodobnych (13 szczepów C.albicans oraz 9 szczepów C.glabrata) wyizolowanych od pacjentów OAiIT. Materiał do opracowania stanowiły wyniki badań mikologicznych materiałów klinicznych, pobranych od pacjentów leczonych w oddziałach: Anestezjologii i Intensywnej Terapii, Kliniki Chirurgii Czaszkowo- Szczękowo- Twarzowej, Onkologicznej i Rekonstrukcyjnej, Leczenia Oparzeń oraz Chorób Wewnętrznych, wykonane w Pracowni Mikrobiologicznej Zakładu Diagnostyki Laboratoryjnej. Do typowania genetycznego z zastosowaniem metody RAPD- PCR wykorzystano 13 szczepów Candida albicans oraz 9 szczepów Candida glabrata wyizolowanych z próbek aspiratów tchawicznych (20) oraz moczu (2) od pacjentów OAiIT Szpitala Specjalistycznego im. Ludwika Rydygiera w Krakowie. Badanie podobieństwa genetycznego izolatów wykonano przy użyciu pięciu starterów: CD16AS, HP1247, ERIC-2, OPE-3 oraz OPE-18.W wyniku przeprowadzonej oceny zakażeń/ kolonizacji, w 49 materiałach klinicznych izolowanych od pacjentów OAiIT wyhodowano grzyby w stężeniu patologicznie znamiennym (≥104 CFU/ml), co sugerowało konieczność zastosowania profilaktyki/leczenia przeciwgrzybicznego. W pozostałych przypadkach ilość grzybów była patologicznie nieznamienna lub wynik hodowli był ujemny (6 materiałów). Najczęściej izolowanym czynnikiem etiologicznym, we wszystkich analizowanych oddziałach, był gatunek C.albicans.Analiza pokrewieństwa genetycznego wśród 22 szczepów grzybów drożdżopodobnych wyizolowanych od chorych OAiIT wykazała duży stopień homologii. Wśród izolatów 100% podobieństwa genetycznego dowiedziono u 4 szczepów C.albicans oraz 3 C.glabrata, co mogło sugerować utrzymywanie się danych szczepów na terenie szpitala.

The aim of this study was to evaluate the occurrence of colonization / fungal infections in patients hospitalized in 2013 in selected departments of Ludwik Rydygier’s Hospital in Cracow, and to determine the genetic diversity among 22 strains of yeast-like fungi (13 strains of C.albicans and 9 strains C.glabrata) isolated from patients OAiIT.The material included in the study contained the mycological test results, taken from patients treated in departments: Anaesthesiology and Intensive Care, Department of Surgery cephalo Maxillofacial Oncologic and Reconstructive Surgery, Burns and Internal Medicine, performed at the Laboratory of Microbiology Department of Laboratory Diagnostics.For genetic typing with PCR RAPD- method used 13 strains of Candida albicans and 9 strains of Candida glabrata isolated from tracheal aspirate samples (20) and urine samples (2) of patients OAiIT Ludwik Rydygier’s Hospital in Cracow. Research of genetic similarity of isolates was performed using five primers: CD16AS, HP1247, ERIC-2, OPE-3, and OPE-18. Studies concerning fungal infection/colonization revealed, that in 49 clinical specimens isolated from patients OAiIT fungi grown at a concentration of pathologically significant (≥104 CFU/ml), suggesting the need for prevention/ treatment of the antifungal drugs. In other cases, the amount of fungi was pathologically insignificant or the result of culture was negative (6 clinical specimens).Candida albicans was the most frequently isolated etiological agent in all analyzed departments.Analysis of genetic relationships among 22 strains of yeast-like fungi isolated from patients OAiIT showed a high degree of homology. Among the isolates 100% genetic similarity demonstrated in 4 strains of C.albicans and 3 C.glabrata, which could suggest the persistence of strains in the hospital.