Badanie wpływu czynników zewnętrznych na sposób tworzenia kompleksów białko-ligand w fazie krystalicznej

master
dc.abstract.enVariants of recombinant lactoglobulin possessing substitutions: I56F-L39A-M107F (FA/56F), I56F-L39A-M107W (FA/56W), F105L-L39A-M107W (LA/107W), F105L-L39A-I56W (LA/56W) were produced and purified. It was tested how ionic strength, pH and ligand concentration affect the process of forming a protein-ligand complex in the crystalline phase. Crystals of various morphology were obtained - resembling "rhombi", "rectangles" and in the form of needles. Crystals of variants FA/56F and FA/56W were sent to the BESSY II synchrotron (Berlin) to collect X-ray diffraction data. Previous observations regarding the relationship between protein / ligand molar ratio and crystal morphology and their crystal structure were confirmed. In addition, for the first time data with a resolution of 1.24 Å was collected, this is the highest resolution at which the structure of the lactoglobulin-ligand complex has ever been determined.pl
dc.abstract.plWyprodukowano i oczyszczono warianty rekombinowanej laktoglobuliny posiadające substytucje: I56F-L39A-M107F (FA/56F), I56F-L39A-M107W (FA/56W), F105L-L39A-M107W (LA/107W), F105L-L39A-I56W (LA/56W). Zbadano, jak siła jonowa, pH oraz stężenie liganda wpływa na proces tworzenia kompleksu białko-ligand w fazie krystalicznej. Otrzymano kryształy o różnej morfologii – przypominające „romby”, „prostokąty” oraz w formie igieł. Kryształy wariantów FA/56F oraz FA/56W wysłano na synchrotron BESSY II (Berlin) w celu wykonania pomiarów dyfraktometrycznych. Potwierdzono wcześniejsze obserwacje dotyczące zależności między stosunkiem molowym białko/ligand, a morfologią kryształów i ich strukturą krystaliczną. Dodatkowo po raz pierwszy zebrano dane o rozdzielczości 1.24 Å, jest to najwyższa rozdzielczość z jaką kiedykolwiek wyznaczono strukturę kompleksu laktoglobulina-ligand.pl
dc.affiliationWydział Chemiipl
dc.areaobszar nauk ścisłychpl
dc.contributor.advisorLoch, Joannapl
dc.contributor.authorKarcz, Klaudiapl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WC3pl
dc.contributor.reviewerLoch, Joannapl
dc.contributor.reviewerMadej, Katarzyna - 130167 pl
dc.date.accessioned2020-07-28T05:13:38Z
dc.date.available2020-07-28T05:13:38Z
dc.date.submitted2020-07-01pl
dc.fieldofstudychemiapl
dc.identifier.apddiploma-138415-196075pl
dc.identifier.projectAPD / Opl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/239851
dc.languagepolpl
dc.subject.enrecombinant β-lactoglobulin, ligand binding, protein-ligand complex, crystal structure, crystal morphologypl
dc.subject.plrekombinowana β-laktoglobulina, wiązanie ligandów, kompleks białko-ligand, struktura krystaliczna, morfologia kryształówpl
dc.titleBadanie wpływu czynników zewnętrznych na sposób tworzenia kompleksów białko-ligand w fazie krystalicznejpl
dc.title.alternativeInvestigations of the influence of external factors on the process of formation of protein-ligand complexes in the crystalline phasepl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
Variants of recombinant lactoglobulin possessing substitutions: I56F-L39A-M107F (FA/56F), I56F-L39A-M107W (FA/56W), F105L-L39A-M107W (LA/107W), F105L-L39A-I56W (LA/56W) were produced and purified. It was tested how ionic strength, pH and ligand concentration affect the process of forming a protein-ligand complex in the crystalline phase. Crystals of various morphology were obtained - resembling "rhombi", "rectangles" and in the form of needles. Crystals of variants FA/56F and FA/56W were sent to the BESSY II synchrotron (Berlin) to collect X-ray diffraction data. Previous observations regarding the relationship between protein / ligand molar ratio and crystal morphology and their crystal structure were confirmed. In addition, for the first time data with a resolution of 1.24 Å was collected, this is the highest resolution at which the structure of the lactoglobulin-ligand complex has ever been determined.
dc.abstract.plpl
Wyprodukowano i oczyszczono warianty rekombinowanej laktoglobuliny posiadające substytucje: I56F-L39A-M107F (FA/56F), I56F-L39A-M107W (FA/56W), F105L-L39A-M107W (LA/107W), F105L-L39A-I56W (LA/56W). Zbadano, jak siła jonowa, pH oraz stężenie liganda wpływa na proces tworzenia kompleksu białko-ligand w fazie krystalicznej. Otrzymano kryształy o różnej morfologii – przypominające „romby”, „prostokąty” oraz w formie igieł. Kryształy wariantów FA/56F oraz FA/56W wysłano na synchrotron BESSY II (Berlin) w celu wykonania pomiarów dyfraktometrycznych. Potwierdzono wcześniejsze obserwacje dotyczące zależności między stosunkiem molowym białko/ligand, a morfologią kryształów i ich strukturą krystaliczną. Dodatkowo po raz pierwszy zebrano dane o rozdzielczości 1.24 Å, jest to najwyższa rozdzielczość z jaką kiedykolwiek wyznaczono strukturę kompleksu laktoglobulina-ligand.
dc.affiliationpl
Wydział Chemii
dc.areapl
obszar nauk ścisłych
dc.contributor.advisorpl
Loch, Joanna
dc.contributor.authorpl
Karcz, Klaudia
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WC3
dc.contributor.reviewerpl
Loch, Joanna
dc.contributor.reviewerpl
Madej, Katarzyna - 130167
dc.date.accessioned
2020-07-28T05:13:38Z
dc.date.available
2020-07-28T05:13:38Z
dc.date.submittedpl
2020-07-01
dc.fieldofstudypl
chemia
dc.identifier.apdpl
diploma-138415-196075
dc.identifier.projectpl
APD / O
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/239851
dc.languagepl
pol
dc.subject.enpl
recombinant β-lactoglobulin, ligand binding, protein-ligand complex, crystal structure, crystal morphology
dc.subject.plpl
rekombinowana β-laktoglobulina, wiązanie ligandów, kompleks białko-ligand, struktura krystaliczna, morfologia kryształów
dc.titlepl
Badanie wpływu czynników zewnętrznych na sposób tworzenia kompleksów białko-ligand w fazie krystalicznej
dc.title.alternativepl
Investigations of the influence of external factors on the process of formation of protein-ligand complexes in the crystalline phase
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
7
Views per month
Views per city
Gdynia
2
Wroclaw
2
Dublin
1
Kluczbork
1
Poznan
1

No access

No Thumbnail Available