Assessment of ligand binding susceptibility for CD112 protein - in silico analysis and fragment screening method testing.

Białko CD112, zwane także nektyną-2 jest transbłonowym receptorem, nadekspresjonowanym na powierzchni komórek nowotworowych, głównie raka piersi i jajnika. Należy do cząsteczek adhezyjnych rodziny nektyn, niezależnych od jonów wapnia. Pełni ważne funkcje w różnych procesach komórkowych, w tym w rozpoznawaniu komórek przez układ odpornościowy oraz przyczynia się do transformacji nowotworowej. Interakcja z powierzchniowym receptorem TIGIT na limfocytach T i komórkach NK pełni ważną rolę w hamowaniu odpowiedzi immunologicznej organizmu na transformację nowotworową. W niniejszej pracy z powodzeniem wyprodukowano monomer białka CD112. Dokonano również ocenę podatności CD112 na wiązanie ligandów metodą in silico oraz przetestowano 192 związki chemiczne o charakterze fragmentów w celu znalezienia cząsteczek mogących stanowić punkty wyjścia do otrzymywania inhibitorów.

The CD112 protein, also called nectin-2, is a transmembrane receptor overexpressed on the surface of neoplastic cells, mainly breast and ovarian cancer. It belongs to the adhesion molecules of the nectin family, independent of calcium ions. It plays important roles in various cellular processes, including recognition of cells by the immune system, and contributes to neoplastic transformation. Interaction with the surface TIGIT receptor on T lymphocytes and NK cells plays an important role in inhibiting the body's immune response to neoplastic transformation. In this work, the monomer of the CD112 protein was successfully produced. The susceptibility of CD112 to ligand binding was assessed by in silico method, and 192 chemical compounds in the form of fragments were tested in order to find molecules that could serve as starting points for the production of inhibitors.