The analysis of clonal structure and occurrence of agr and sar genes in Staphylococcus lugdunensis strains from laryngological patients.

Staphylococcus lugdunensis jest jednym z najistotniejszych oportunistycznych gatunków patogennych w obrębie rodzaju Staphylococcus, należącym do CoNS (ang. coagulase-negative staphylococci). Naturalnie kolonizuje on ludzką skórę, ale może przyczyniać się do powstawania poważnych i / lub chronicznych infekcji różnych narządów, szczególnie u pacjentów w wieku średnim lub immunosupresyjnych. Przykładem takiej infekcji jest przewlekłe zapalenie błon śluzowych zatok. Celem pracy było wyznaczenie struktury klonalnej kolekcji szczepów bakteryjnych i ustalenie, czy już wcześniej zostały one zidentyfikowane na świecie. Ponadto u wspomnianych patogenów oportunistycznych wykrywano także geny regulatorowe: agr opartego na mechanizmie quorum sensing oraz sarA, które współpracują w kontrolowaniu ekspresji czynników wirulencji. W niniejszej pracy, stosując technikę MLST (ang. Multilocus Sequence Typing) wyznaczono strukturę klonalną dwunastu analizowanych szczepów S. lugdunensis wyizolowanych z błon śluzowych zatok w stanie przewlekłego zapalenia od dorosłych pacjentów laryngologicznych. Większość izolatów należało do najpowszechniejszego trzeciego typu sekwencyjnego. Ponadto, stwierdzono u wspomnianych szczepów obecność genów agr typu I oraz bardziej wirulentnego – typu II, a także sarA za pomocą metody PCR. Przeważająca część badanych szczepów posiadała typ II genu agr.

Staphylococcus lugdunensis is one of the most important opportunistic pathogenic species within the Staphylococcus genus, belonging to the CoNS (coagulase-negative staphylococci). It naturally colonises human skin, but can contribute to serious and/or chronic infections of various organs, especially in middle-aged or immunosuppressed patients. An example of such an infection is chronic sinusitis. The aim of this study was to determine the clonal structure of a collection of the bacterial strains in question and thus to determine whether they had already been identified worldwide. In addition, regulatory genes were also detected in these opportunistic pathogens: agr based on a quorum sensing mechanism and sarA, which cooperate in controlling the expression of virulence factors. In the present study, the clonal structure of twelve analysed S. lugdunensis strains isolated from sinus mucosa in chronic inflammation from adult laryngological patients was determined using MLST (Multilocus Sequence Typing) technique. Most isolates belong to the most common third sequence type. Moreover, the presence of agr type I and more virulent agr type II genes, as well as sarA genes was detected in these strains by PCR. Most of the tested strains possessed type II agr gene.