Expression of APOBEC3C protein in 293T cells

APOBEC3C jest jednym z 11 białek należących do rodziny deaminaz cytydynowych APOBEC. Ze względu na zdolność do wiązania DNA lub RNA i deaminacji cytydyny lub deoksycytydyny do urydyny lub deoksyurydyny niektóre białka należące to tej rodziny – APOBEC3, stanowią element naturalnej obrony organizmu przed infekcjami wirusowymi. Modyfikując materiał genetyczny wirusa hamują jego replikację. Pozostałe białka rodziny APOBEC pełnią także inne funkcje, między innymi powodują powstanie krótszej formy apolipoproteiny B, uczestniczą w zjawisku hipermutacji somatycznej w limfocytach typu B oraz przy przełączaniu klas przeciwciał. Funkcje dwóch białek – APOBEC2 i APOBEC4 wciąż nie są zbyt dobrze znane. Poznanie i analiza sposobów działania białek APOBEC może pozwolić na lepsze zrozumienie mechanizmów zakażenia, a być może w przyszłości także na powstanie nowych leków skierowanych przeciwko istniejącym już i potencjalnym nowym patogenom. Celem pracy było przeprowadzenie ekspresji białka APOBEC3C w systemie eukariotycznym – komórkach linii 293T. Aby tego dokonać przeprowadzono transfekcję komórek plazmidem kodującym białko APOBEC3C. W celu sprawdzenia czy białko powstaje, lizaty komórkowe poddano analizie Western blot.

APOBEC3C is one of the proteins from cytidine deaminase family, APOBEC. Due to their capability of binding DNA or RNA and deamination of cytidine or deoxycytidine to uridine or deaoxyuridine, some proteins belonging to this family – APOBEC3, are taking part in natural defense against viral pathogens. By modifying the genetic material of the virus, they inhibit its replication. Other proteins of APOBEC family serve various other functions, for example causing the creation of apolipoprotein B’s shorter form, participating in somatic hipermutation in B lyphocytes and switching classes of antibodies. The functions of APOBEC2 and APOBEC4 are still not well known. Learning and analyzing the ways of acting of APOBEC proteins can help with better understanding mechanisms of infection and possibly also with creating new drugs against already known or potential pathogens in the future. The aim of this work was expression of APOBEC3C protein on eukaryotic system – cell line 293T. To do so, the cells were transfected with a plasmid coding APOBEC3C protein. In order to check if the protein is created, cell lysates were analyzed using Western blot technique.