Probabilistyczne modele wiązania chemicznego w przestrzeniach funkcyjnych

thesis
dc.abstract.enIn this work I probed selected probabilistic models of chemical interactions based on the Communication Theory of the Chemical Bond, originally proposed by prof. R.F. Nalewajski. My work focused mainly on the analysis of molecular communication systems in orbital and atomic (condensed) resolution in terms of their effective applicability in quantum-chemical calculations for both, species with well-known electronic structure and those being still a subject of discussion in scientific literature. The most important results of the present study are as follows: • Determination of the influence of basis set and resolution reduction on properties of molecular communication systems; quantitative evaluation of the effect of polarization functions on the effective representation of minimal set of atomic orbitals. • Definition of alternative measure of entropic bond-order and the corresponding covalency/ionicity component, based on decomposition of communication "noise" within molecular information channel. Also, determination of relationship between the input probability distribution and the type of electronic-structure information scattered within communication system. • The procedure of decomposition of multi-center bond orders into symmetry components based on the concept of molecular communication system within molecular/natural orbital resolution. • Definition of the correlation coefficient of two chemical bonds, involving the concept of through-space and through-bridge AO interactions within the framework of communication theory and the theory of Markov chains. • Generalization of definition of conditional probability matrix of information channels within atomic orbital resolution on multi-determinant wavefunctions. Keywords: chemical bond, bond order, Shannon entropy, communication channel, information theory, Markov chain, covalency, ionicity, natural orbital, atomic orbital, density matrix, conditional probability.pl
dc.abstract.plW pracy tej badano wybrane probabilistyczne modele oddziaływań chemicznych wywodzące się z komunikacyjnej teorii wiązania chemicznego oryginalnie zaproponowanej przez prof. R.F. Nalewajskiego. Skupiono się głównie na analizie molekularnych układów komunikacyjnych w rozdzielczościach orbitalowych i atomowych pod kątem ich praktycznego zastosowania w obliczeniach kwantowochemicznych, zarówno cząsteczek o dobrze określonej strukturze elektronowej, jak i tych będących ciągle przedmiotem dyskusji w literaturze naukowej. Do najważniejszych wyników uzyskanych w ramach pracy doktorskiej należy zaliczyć: • Określenie wpływu redukcji rozdzielczości i zmiany bazy na właściwości molekularnych układów komunikacyjnych oraz ilościowe zbadanie wpływu funkcji polaryzacyjnych na właściwości efektywnej reprezentacji bazy minimalnej orbitali atomowych. • Zdefiniowanie alternatywnych miar entropowych rzędów wiązań oraz ich składowych, jonowej i kowalencyjnej, poprzez dekompozycję szumu komunikacyjnego w molekularnych kanałach informacyjnych. Określenie wpływu typu rozkładu prawdopodobieństw na wejściu kanału informacyjnego na rodzaj ekstrahowanej informacji o strukturze elektronowej wiązań. • Opracowanie metody dekompozycji dwu- i wielocentrowych rzędów wiązań na składowe o określonej symetrii, z wykorzystaniem molekularnych kanałów komunikacyjnych w rozdzielczości orbitali molekularnych/naturalnych. • Zdefiniowanie współczynnika korelacji wiązań chemicznych, bazującego na koncepcji pośrednich i bezpośrednich oddziaływań orbitali atomowych w formalizmie teorii komunikacyjnej i teorii łańcuchów Markowa. • Uogólnienie definicji macierzy prawdopodobieństw warunkowych kanałów informacyjnych w rozdzielczości orbitali atomowych na wielowyznacznikowe funkcje falowe. Słowa kluczowe: wiązanie chemiczne, rząd wiązania, entropia Shannona, kanał komunikacyjny, teoria informacji, łańcuch Markowa, kowalencyjność, jonowość, orbital naturalny, orbital atomowy, macierz gęstości, prawdopodobieństwo warunkowe.pl
dc.affiliationWydział Chemii : Zakład Metod Obliczeniowych Chemiipl
dc.contributor.advisorMrozek, Janusz - 130781 pl
dc.contributor.authorSzczepanik, Dariusz - 141875 pl
dc.contributor.institutionUniwersytet Jagielloński. Wydział Chemii. Zakład Metod Obliczeniowych Chemiipl
dc.contributor.reviewerKomorowski, Ludwikpl
dc.contributor.reviewerKorchowiec, Jacek - 129106 pl
dc.date.accessioned2022-06-20T10:56:23Z
dc.date.available2022-06-20T10:56:23Z
dc.date.openaccess0
dc.date.submitted2013-09-30pl
dc.description.accesstimew momencie opublikowania
dc.description.additionalBibliogr. s. 78-85pl
dc.description.physicalXII, 85pl
dc.description.versionostateczna wersja autorska (postprint)
dc.identifier.callnumberDokt. 2013/214pl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/293111
dc.languagepolpl
dc.placeKrakówpl
dc.rightsCopyright*
dc.rights.licenceInna otwarta licencja
dc.rights.simpleviewWolny dostęp
dc.rights.urihttp://ruj.uj.edu.pl/4dspace/License/copyright/licencja_copyright.pdf*
dc.share.typeotwarte repozytorium
dc.subject.enchemical bondpl
dc.subject.enbond orderpl
dc.subject.enshannon entropypl
dc.subject.encommunication channelpl
dc.subject.eninformation theorypl
dc.subject.plwiązanie chemicznepl
dc.subject.plrząd wiązaniapl
dc.subject.plentropia shannonapl
dc.subject.plkanał komunikacyjnypl
dc.subject.plteoria informacjipl
dc.titleProbabilistyczne modele wiązania chemicznego w przestrzeniach funkcyjnychpl
dc.title.alternativeProbabilistic models of the chemical bond in the function spacespl
dc.typeThesispl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
In this work I probed selected probabilistic models of chemical interactions based on the Communication Theory of the Chemical Bond, originally proposed by prof. R.F. Nalewajski. My work focused mainly on the analysis of molecular communication systems in orbital and atomic (condensed) resolution in terms of their effective applicability in quantum-chemical calculations for both, species with well-known electronic structure and those being still a subject of discussion in scientific literature. The most important results of the present study are as follows: • Determination of the influence of basis set and resolution reduction on properties of molecular communication systems; quantitative evaluation of the effect of polarization functions on the effective representation of minimal set of atomic orbitals. • Definition of alternative measure of entropic bond-order and the corresponding covalency/ionicity component, based on decomposition of communication "noise" within molecular information channel. Also, determination of relationship between the input probability distribution and the type of electronic-structure information scattered within communication system. • The procedure of decomposition of multi-center bond orders into symmetry components based on the concept of molecular communication system within molecular/natural orbital resolution. • Definition of the correlation coefficient of two chemical bonds, involving the concept of through-space and through-bridge AO interactions within the framework of communication theory and the theory of Markov chains. • Generalization of definition of conditional probability matrix of information channels within atomic orbital resolution on multi-determinant wavefunctions. Keywords: chemical bond, bond order, Shannon entropy, communication channel, information theory, Markov chain, covalency, ionicity, natural orbital, atomic orbital, density matrix, conditional probability.
dc.abstract.plpl
W pracy tej badano wybrane probabilistyczne modele oddziaływań chemicznych wywodzące się z komunikacyjnej teorii wiązania chemicznego oryginalnie zaproponowanej przez prof. R.F. Nalewajskiego. Skupiono się głównie na analizie molekularnych układów komunikacyjnych w rozdzielczościach orbitalowych i atomowych pod kątem ich praktycznego zastosowania w obliczeniach kwantowochemicznych, zarówno cząsteczek o dobrze określonej strukturze elektronowej, jak i tych będących ciągle przedmiotem dyskusji w literaturze naukowej. Do najważniejszych wyników uzyskanych w ramach pracy doktorskiej należy zaliczyć: • Określenie wpływu redukcji rozdzielczości i zmiany bazy na właściwości molekularnych układów komunikacyjnych oraz ilościowe zbadanie wpływu funkcji polaryzacyjnych na właściwości efektywnej reprezentacji bazy minimalnej orbitali atomowych. • Zdefiniowanie alternatywnych miar entropowych rzędów wiązań oraz ich składowych, jonowej i kowalencyjnej, poprzez dekompozycję szumu komunikacyjnego w molekularnych kanałach informacyjnych. Określenie wpływu typu rozkładu prawdopodobieństw na wejściu kanału informacyjnego na rodzaj ekstrahowanej informacji o strukturze elektronowej wiązań. • Opracowanie metody dekompozycji dwu- i wielocentrowych rzędów wiązań na składowe o określonej symetrii, z wykorzystaniem molekularnych kanałów komunikacyjnych w rozdzielczości orbitali molekularnych/naturalnych. • Zdefiniowanie współczynnika korelacji wiązań chemicznych, bazującego na koncepcji pośrednich i bezpośrednich oddziaływań orbitali atomowych w formalizmie teorii komunikacyjnej i teorii łańcuchów Markowa. • Uogólnienie definicji macierzy prawdopodobieństw warunkowych kanałów informacyjnych w rozdzielczości orbitali atomowych na wielowyznacznikowe funkcje falowe. Słowa kluczowe: wiązanie chemiczne, rząd wiązania, entropia Shannona, kanał komunikacyjny, teoria informacji, łańcuch Markowa, kowalencyjność, jonowość, orbital naturalny, orbital atomowy, macierz gęstości, prawdopodobieństwo warunkowe.
dc.affiliationpl
Wydział Chemii : Zakład Metod Obliczeniowych Chemii
dc.contributor.advisorpl
Mrozek, Janusz - 130781
dc.contributor.authorpl
Szczepanik, Dariusz - 141875
dc.contributor.institutionpl
Uniwersytet Jagielloński. Wydział Chemii. Zakład Metod Obliczeniowych Chemii
dc.contributor.reviewerpl
Komorowski, Ludwik
dc.contributor.reviewerpl
Korchowiec, Jacek - 129106
dc.date.accessioned
2022-06-20T10:56:23Z
dc.date.available
2022-06-20T10:56:23Z
dc.date.openaccess
0
dc.date.submittedpl
2013-09-30
dc.description.accesstime
w momencie opublikowania
dc.description.additionalpl
Bibliogr. s. 78-85
dc.description.physicalpl
XII, 85
dc.description.version
ostateczna wersja autorska (postprint)
dc.identifier.callnumberpl
Dokt. 2013/214
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/293111
dc.languagepl
pol
dc.placepl
Kraków
dc.rights*
Copyright
dc.rights.licence
Inna otwarta licencja
dc.rights.simpleview
Wolny dostęp
dc.rights.uri*
http://ruj.uj.edu.pl/4dspace/License/copyright/licencja_copyright.pdf
dc.share.type
otwarte repozytorium
dc.subject.enpl
chemical bond
dc.subject.enpl
bond order
dc.subject.enpl
shannon entropy
dc.subject.enpl
communication channel
dc.subject.enpl
information theory
dc.subject.plpl
wiązanie chemiczne
dc.subject.plpl
rząd wiązania
dc.subject.plpl
entropia shannona
dc.subject.plpl
kanał komunikacyjny
dc.subject.plpl
teoria informacji
dc.titlepl
Probabilistyczne modele wiązania chemicznego w przestrzeniach funkcyjnych
dc.title.alternativepl
Probabilistic models of the chemical bond in the function spaces
dc.typepl
Thesis
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
22
Views per month
Views per city
Krakow
13
Bialystok
1
Dublin
1
Poznan
1
Warsaw
1
Świnoujście
1
Downloads
szczepanik_probabilistyczne_modele_wiazania_chemicznego_2013.pdf
16
szczepanik_probabilistyczne_modele_wiazania_chemicznego_2013.odt
3