Badania oddziaływania receptora dopaminowego D1 z podjednostką αs białka G

master
dc.abstract.enG protein-coupled receptors represent largest family of integral membrane proteins. In the human genome were identified more than 800 GPCR genes. The G protein-coupled receptor is activated by an external signal in the form of a ligand or other signal mediator. This creates a conformational change in the receptor, causing activation of a G protein. Molecular mechanism of receptor interactions with G proteins remains unrecognized. There are still unanswered questions: whether G proteins couple before or after receptor activation, whether GPCR oligomerization involves changes in ligand recognition or G protein-coupling. This thesis summarizes an attempt to test the hypothesis of receptor-G protein precoupling using D1 dopamine receptor and αsL subunit of G protein. FlAsH-EDT2 was used as a site-specific label of the III cytoplasmic loop and C-terminal of the dopamine receptor. This method is based on the binding of small fluorescein derivative, called fluorescein arsenical hairpin binder (FlAsH), to a short peptide sequence Cys-Cys-Pro-Gly-Cys-Cys (CCPGCC). The signal to noise ratio of the FlAsH dye is relatively low. Further optimization of labeling motif and/or labeling conditions appears to be required if the specificity of labeling is to be improved. Precoupling was investigated by Forster resonance energy transfer (FRET) measured by fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM). Chimeras with the fluorescent proteins Citrine and mCherry were used to detect precoupling. The results confirmed interaction between proteins.An attempt was also made to create a fluorescence complementation-based system for the study of D2 and/or D1 dopamine receptors homo- and heterodimers. The C-terminus of D2 dopamine receptor was extended to facilitate fluorescence complementation. D2 homodimers have been visualized in HEK293 cells.pl
dc.abstract.plReceptory sprzężone z białkami G stanową największą rodzinę białek błonowych. W ludzkim genomie zidentyfikowano ponad 800 genów kodujących te receptory. Receptory metabotropowe aktywowane są przez zewnętrzny sygnał w formie ligandu lub innego mediatora. Związanie ligandu wywołuje zmiany konformacyjne receptora, skutkujące aktywacją białka G. Mechanizmy molekularne oddziaływania receptorów z białkami G pozostają nierozpoznane. Wciąż istnieją pytania bez odpowiedzi: czy białko G wiąże się z receptorem przed czy po aktywacji samego receptora, czy oligomeryzacja receptorów metabotropowych wywołuje zmiany w rozpoznawaniu liganda czy w związaniu białka G.Celem niniejszej pracy była weryfikacja hipotezy dotyczącej prekompleksowania receptorów i białek G. Odziaływanie badano w układzie modelowym złożonym z receptora dopaminowego D1 oraz podjednostki αsL białka G. W badaniach wykorzystano barwnik FlAsH rozpoznający motyw sekwencji wprowadzony do trzeciej pętli wewnątrzkomórkowej (IC-3) oraz C-końca receptora dopaminowego. Metoda znakowania barwnikiem FlAsH polega na wiązaniu się małej, arsenowej pochodnej fluoresceiny do sześcioaminokwasowej sekwencji Cys-Cys-Pro-Gly-Cys-Cys (CCPGCC). Uzyskany stosunek sygnału do szumu dla znacznika FlAsH jest bardzo niski. W celu potwierdzenia specyficznego znakowania potrzebne są dalsze optymalizacje rozpoznawanej sekwencji i/lub warunków, w których przeprowadza się znakowanie. Tworzenie kompleksów receptora z białkiem G badano poprzez pomiary rezonansowego transferu energii techniką obrazowania czasów życia fluorescencji (FRET-FLIM). W celu detekcji prekompleksów wykorzystano badane białka połączone z białkami fluorescencyjnymi Citrine oraz mCherry. Uzyskane wyniki potwierdziły oddziaływanie pomiędzy białkami w badanym układzie. Podjęto także próbę stworzenia układu modelowego na bazie fluorescencyjnego dopełnienia (BiFC) do badania homo- i heterodimeryzacji receptorów dopaminowych D2 i/lub D1. W celu ułatwienia reasocjacji fluoroforu wydłużono C-końcowy fragment receptora D2. Układ ten pozwolił na obserwację homodimerów receptora D2 w komórkach HEK293.pl
dc.affiliationWydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologiipl
dc.areaobszar nauk przyrodniczychpl
dc.contributor.advisorPolit, Agnieszka - 131499 pl
dc.contributor.authorMystek, Pawełpl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WBBBpl
dc.contributor.reviewerCzyż, Jarosław - 127677 pl
dc.contributor.reviewerPolit, Agnieszka - 131499 pl
dc.date.accessioned2020-07-24T09:09:33Z
dc.date.available2020-07-24T09:09:33Z
dc.date.submitted2012-06-29pl
dc.fieldofstudybiofizykapl
dc.identifier.apddiploma-67752-77842pl
dc.identifier.projectAPD / Opl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/181151
dc.languagepolpl
dc.subject.enD1 dopamine receptor, G proteins, FlAsH, FRET, FLIM, BiFCpl
dc.subject.plreceptor dopaminowy D1, białka G, FlAsH, FRET, FLIM, BiFCpl
dc.titleBadania oddziaływania receptora dopaminowego D1 z podjednostką αs białka Gpl
dc.title.alternativeStudy of D1 dopamine receptor interaction with G protein alpha subunitpl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
G protein-coupled receptors represent largest family of integral membrane proteins. In the human genome were identified more than 800 GPCR genes. The G protein-coupled receptor is activated by an external signal in the form of a ligand or other signal mediator. This creates a conformational change in the receptor, causing activation of a G protein. Molecular mechanism of receptor interactions with G proteins remains unrecognized. There are still unanswered questions: whether G proteins couple before or after receptor activation, whether GPCR oligomerization involves changes in ligand recognition or G protein-coupling. This thesis summarizes an attempt to test the hypothesis of receptor-G protein precoupling using D1 dopamine receptor and αsL subunit of G protein. FlAsH-EDT2 was used as a site-specific label of the III cytoplasmic loop and C-terminal of the dopamine receptor. This method is based on the binding of small fluorescein derivative, called fluorescein arsenical hairpin binder (FlAsH), to a short peptide sequence Cys-Cys-Pro-Gly-Cys-Cys (CCPGCC). The signal to noise ratio of the FlAsH dye is relatively low. Further optimization of labeling motif and/or labeling conditions appears to be required if the specificity of labeling is to be improved. Precoupling was investigated by Forster resonance energy transfer (FRET) measured by fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM). Chimeras with the fluorescent proteins Citrine and mCherry were used to detect precoupling. The results confirmed interaction between proteins.An attempt was also made to create a fluorescence complementation-based system for the study of D2 and/or D1 dopamine receptors homo- and heterodimers. The C-terminus of D2 dopamine receptor was extended to facilitate fluorescence complementation. D2 homodimers have been visualized in HEK293 cells.
dc.abstract.plpl
Receptory sprzężone z białkami G stanową największą rodzinę białek błonowych. W ludzkim genomie zidentyfikowano ponad 800 genów kodujących te receptory. Receptory metabotropowe aktywowane są przez zewnętrzny sygnał w formie ligandu lub innego mediatora. Związanie ligandu wywołuje zmiany konformacyjne receptora, skutkujące aktywacją białka G. Mechanizmy molekularne oddziaływania receptorów z białkami G pozostają nierozpoznane. Wciąż istnieją pytania bez odpowiedzi: czy białko G wiąże się z receptorem przed czy po aktywacji samego receptora, czy oligomeryzacja receptorów metabotropowych wywołuje zmiany w rozpoznawaniu liganda czy w związaniu białka G.Celem niniejszej pracy była weryfikacja hipotezy dotyczącej prekompleksowania receptorów i białek G. Odziaływanie badano w układzie modelowym złożonym z receptora dopaminowego D1 oraz podjednostki αsL białka G. W badaniach wykorzystano barwnik FlAsH rozpoznający motyw sekwencji wprowadzony do trzeciej pętli wewnątrzkomórkowej (IC-3) oraz C-końca receptora dopaminowego. Metoda znakowania barwnikiem FlAsH polega na wiązaniu się małej, arsenowej pochodnej fluoresceiny do sześcioaminokwasowej sekwencji Cys-Cys-Pro-Gly-Cys-Cys (CCPGCC). Uzyskany stosunek sygnału do szumu dla znacznika FlAsH jest bardzo niski. W celu potwierdzenia specyficznego znakowania potrzebne są dalsze optymalizacje rozpoznawanej sekwencji i/lub warunków, w których przeprowadza się znakowanie. Tworzenie kompleksów receptora z białkiem G badano poprzez pomiary rezonansowego transferu energii techniką obrazowania czasów życia fluorescencji (FRET-FLIM). W celu detekcji prekompleksów wykorzystano badane białka połączone z białkami fluorescencyjnymi Citrine oraz mCherry. Uzyskane wyniki potwierdziły oddziaływanie pomiędzy białkami w badanym układzie. Podjęto także próbę stworzenia układu modelowego na bazie fluorescencyjnego dopełnienia (BiFC) do badania homo- i heterodimeryzacji receptorów dopaminowych D2 i/lub D1. W celu ułatwienia reasocjacji fluoroforu wydłużono C-końcowy fragment receptora D2. Układ ten pozwolił na obserwację homodimerów receptora D2 w komórkach HEK293.
dc.affiliationpl
Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
dc.areapl
obszar nauk przyrodniczych
dc.contributor.advisorpl
Polit, Agnieszka - 131499
dc.contributor.authorpl
Mystek, Paweł
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WBBB
dc.contributor.reviewerpl
Czyż, Jarosław - 127677
dc.contributor.reviewerpl
Polit, Agnieszka - 131499
dc.date.accessioned
2020-07-24T09:09:33Z
dc.date.available
2020-07-24T09:09:33Z
dc.date.submittedpl
2012-06-29
dc.fieldofstudypl
biofizyka
dc.identifier.apdpl
diploma-67752-77842
dc.identifier.projectpl
APD / O
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/181151
dc.languagepl
pol
dc.subject.enpl
D1 dopamine receptor, G proteins, FlAsH, FRET, FLIM, BiFC
dc.subject.plpl
receptor dopaminowy D1, białka G, FlAsH, FRET, FLIM, BiFC
dc.titlepl
Badania oddziaływania receptora dopaminowego D1 z podjednostką αs białka G
dc.title.alternativepl
Study of D1 dopamine receptor interaction with G protein alpha subunit
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
16
Views per month
Views per city
Lausanne
4
Wroclaw
3
Dublin
2
Sydney
2
Krakow
1
Lodz
1
Olsztyn
1
Włocławek
1

No access

No Thumbnail Available