Mechanizm generowania biofilmu ze szczególnym uwzględnieniem sił van der Waalsa oraz elektrostatycznych

licenciate
dc.abstract.enMicroorganisms attach to surfaces and generate biofilms. The presence of biofilms in the environment can have positive or negative effects. The negative aspect of biofilm is its participation in hospital infections or the food industry, while the positive significance of biofilm is for example, bioremediation and removal of pollutants from the soil. The benefits for biofilm-forming cells are that they are less exposed to antibiotics and various antimicrobial substances. Physicochemical forces such as van der Waals forces, electrostatic forces or hydrophobic interactions play crucial role in biofilm formation. Bacterial adhesion to a surface has been described as a surface thermodynamic phenomenon and by the basic and extended Derjaguin-Landau-Verwey-Overbeek (DLVO) theory, which is used to describe the interactions between bacteria and a surface or between bacterial cells, assuming that bacterial cells can be treated as colloidal particles. Important factors that are taken into account in the DLVO theory are, among others, the distance of the cell from the substrate, ionic strength, pH or acid-base interaction. Van der Waals forces become more dominant and the cell irreversibly adheres to the surface if the bacterium is close to the surface. On the other hand, if the distance between the cell and the substrate increases, the van der Waals forces drop drastically and the Coulomb interactions become more dominant, causing cell repulsion from the surface. According to the thermodynamics of the surface, the conditions favoring the occurrence of bacterial adhesion are when the Gibbs free energy between the bacteria and the surface is negative (ΔGadh<0). Adhesion becomes irreversible when the bacterial cell is immobilized and the potential energy barrier is broken.pl
dc.abstract.plJedną z form obecności drobnoustrojów w środowisku są biofilmy. Występowanie biofilmów w środowisku może mieć pozytywne lub negatywne skutki. Negatywnym aspektem biofilmu jest jego udział w zakażeniach szpitalnych czy przemyśle spożywczym, natomiast pozytywne znaczenie biofilmu to np. bioremediacja i usuwanie zanieczyszczeń z gleby. Korzyściami dla komórek tworzących biofilm jest fakt, iż są one mniej narażone na działanie antybiotyków oraz różnych substancji przeciwdrobnoustrojowych. Kluczową rolę w formowaniu biofilmu odgrywają siły fizykochemiczne takie jak siły van der Waalsa, elektrostatyczne czy oddziaływania hydrofobowe. Adhezja bakterii do powierzchni została opisane jako zjawisko termodynamiczne powierzchni oraz przy pomocy podstawowej oraz rozszerzonej teorii Derjaguina-Landaua-Verweya-Overbeeka (DLVO), która stosowana jest do opisania wzajemnych wpływów między bakteriami a powierzchnią lub między komórkami bakterii, zakładając że komórki bakteryjne można traktować jako cząstki koloidalne. Ważne czynniki, które uwzględnione są w teorii DLVO to między innymi odległość komórek od podłoża, siła jonowa, pH czy oddziaływanie kwas-zasada. Siły van der Waalsa stają się bardziej dominujące, a komórka nieodwracalnie przylega do powierzchni, jeśli znajduje się ona blisko powierzchni. Z drugiej strony, jeśli odległość między komórką a podłożem zwiększa się, siły van der Waalsa drastycznie spadają, a interakcje kulombowskie stają się bardziej dominujące, co powoduje odpychanie się komórki od powierzchni. Zgodnie z termodynamiką powierzchni warunki sprzyjające wystąpieniu adhezji bakteryjnej są wtedy, gdy międzyfazowa energia swobodna Gibbsa między bakteriami a powierzchnią jest ujemna (ΔGadh<0). Adhezja staje się nieodwracalna, gdy komórka bakteryjna zostanie unieruchomiona i zostanie przebita bariera energii potencjalnej.pl
dc.affiliationWydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologiipl
dc.areaobszar nauk przyrodniczychpl
dc.contributor.advisorMiędzobrodzki, Jacek - 130569 pl
dc.contributor.authorTomala, Kinga - USOS292420 pl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WBBBpl
dc.contributor.reviewerMiędzobrodzki, Jacek - 130569 pl
dc.contributor.reviewerMalec, Przemysław - 130259 pl
dc.date.accessioned2024-09-02T22:52:16Z
dc.date.available2024-09-02T22:52:16Z
dc.date.submitted2024-09-02pl
dc.fieldofstudybiofizyka molekularna i komórkowapl
dc.identifier.apddiploma-176538-292420pl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/handle/item/430748
dc.languagepolpl
dc.subject.enbiofilm, extracellular matrix, hospital infections, bioremediation, non-specific adhesion, specific adhesion, tissue, substratum, surface charge, van der Waals forces, Lewis acid-base interactions, physical forces, Coulomb interactions, ionic strength, electrostatic barrier, dipol moment, double-layer interactions, hydrophilic/hydrophobic interactions, hydrogen bonds, termodynamic theorypl
dc.subject.plbiofilm, macierz zewnątrzkomórkowa, zakażenia szpitalne, bioremediacja, adhezja nieswoista, adhezja swoista, kohezja, polisacharydy zewnątrzkomórkowe, tkanka, podłoże, ładunek powierzchniowy, siły van der Waalsa, oddziaływania kwas-zasada Lewisa, termodynamika powierzchni, analiza Derjaguina-Landaua-Verweya-Overbeeka, siły fizyczne, interakcje kulombowskie, siła jonowa, bariera elektrostatyczna, moment dipolowy, oddziaływanie dwuwarstwowe, oddziaływania hydrofobowe/hydrofilowe, wiązania wodorowe, teoria termodynamiczna,pl
dc.titleMechanizm generowania biofilmu ze szczególnym uwzględnieniem sił van der Waalsa oraz elektrostatycznychpl
dc.title.alternativeMechanism of biofilm formation with special emphasis on van der Waals and electrostatic forcespl
dc.typelicenciatepl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
Microorganisms attach to surfaces and generate biofilms. The presence of biofilms in the environment can have positive or negative effects. The negative aspect of biofilm is its participation in hospital infections or the food industry, while the positive significance of biofilm is for example, bioremediation and removal of pollutants from the soil. The benefits for biofilm-forming cells are that they are less exposed to antibiotics and various antimicrobial substances. Physicochemical forces such as van der Waals forces, electrostatic forces or hydrophobic interactions play crucial role in biofilm formation. Bacterial adhesion to a surface has been described as a surface thermodynamic phenomenon and by the basic and extended Derjaguin-Landau-Verwey-Overbeek (DLVO) theory, which is used to describe the interactions between bacteria and a surface or between bacterial cells, assuming that bacterial cells can be treated as colloidal particles. Important factors that are taken into account in the DLVO theory are, among others, the distance of the cell from the substrate, ionic strength, pH or acid-base interaction. Van der Waals forces become more dominant and the cell irreversibly adheres to the surface if the bacterium is close to the surface. On the other hand, if the distance between the cell and the substrate increases, the van der Waals forces drop drastically and the Coulomb interactions become more dominant, causing cell repulsion from the surface. According to the thermodynamics of the surface, the conditions favoring the occurrence of bacterial adhesion are when the Gibbs free energy between the bacteria and the surface is negative (ΔGadh<0). Adhesion becomes irreversible when the bacterial cell is immobilized and the potential energy barrier is broken.
dc.abstract.plpl
Jedną z form obecności drobnoustrojów w środowisku są biofilmy. Występowanie biofilmów w środowisku może mieć pozytywne lub negatywne skutki. Negatywnym aspektem biofilmu jest jego udział w zakażeniach szpitalnych czy przemyśle spożywczym, natomiast pozytywne znaczenie biofilmu to np. bioremediacja i usuwanie zanieczyszczeń z gleby. Korzyściami dla komórek tworzących biofilm jest fakt, iż są one mniej narażone na działanie antybiotyków oraz różnych substancji przeciwdrobnoustrojowych. Kluczową rolę w formowaniu biofilmu odgrywają siły fizykochemiczne takie jak siły van der Waalsa, elektrostatyczne czy oddziaływania hydrofobowe. Adhezja bakterii do powierzchni została opisane jako zjawisko termodynamiczne powierzchni oraz przy pomocy podstawowej oraz rozszerzonej teorii Derjaguina-Landaua-Verweya-Overbeeka (DLVO), która stosowana jest do opisania wzajemnych wpływów między bakteriami a powierzchnią lub między komórkami bakterii, zakładając że komórki bakteryjne można traktować jako cząstki koloidalne. Ważne czynniki, które uwzględnione są w teorii DLVO to między innymi odległość komórek od podłoża, siła jonowa, pH czy oddziaływanie kwas-zasada. Siły van der Waalsa stają się bardziej dominujące, a komórka nieodwracalnie przylega do powierzchni, jeśli znajduje się ona blisko powierzchni. Z drugiej strony, jeśli odległość między komórką a podłożem zwiększa się, siły van der Waalsa drastycznie spadają, a interakcje kulombowskie stają się bardziej dominujące, co powoduje odpychanie się komórki od powierzchni. Zgodnie z termodynamiką powierzchni warunki sprzyjające wystąpieniu adhezji bakteryjnej są wtedy, gdy międzyfazowa energia swobodna Gibbsa między bakteriami a powierzchnią jest ujemna (ΔGadh<0). Adhezja staje się nieodwracalna, gdy komórka bakteryjna zostanie unieruchomiona i zostanie przebita bariera energii potencjalnej.
dc.affiliationpl
Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
dc.areapl
obszar nauk przyrodniczych
dc.contributor.advisorpl
Międzobrodzki, Jacek - 130569
dc.contributor.authorpl
Tomala, Kinga - USOS292420
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WBBB
dc.contributor.reviewerpl
Międzobrodzki, Jacek - 130569
dc.contributor.reviewerpl
Malec, Przemysław - 130259
dc.date.accessioned
2024-09-02T22:52:16Z
dc.date.available
2024-09-02T22:52:16Z
dc.date.submittedpl
2024-09-02
dc.fieldofstudypl
biofizyka molekularna i komórkowa
dc.identifier.apdpl
diploma-176538-292420
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/handle/item/430748
dc.languagepl
pol
dc.subject.enpl
biofilm, extracellular matrix, hospital infections, bioremediation, non-specific adhesion, specific adhesion, tissue, substratum, surface charge, van der Waals forces, Lewis acid-base interactions, physical forces, Coulomb interactions, ionic strength, electrostatic barrier, dipol moment, double-layer interactions, hydrophilic/hydrophobic interactions, hydrogen bonds, termodynamic theory
dc.subject.plpl
biofilm, macierz zewnątrzkomórkowa, zakażenia szpitalne, bioremediacja, adhezja nieswoista, adhezja swoista, kohezja, polisacharydy zewnątrzkomórkowe, tkanka, podłoże, ładunek powierzchniowy, siły van der Waalsa, oddziaływania kwas-zasada Lewisa, termodynamika powierzchni, analiza Derjaguina-Landaua-Verweya-Overbeeka, siły fizyczne, interakcje kulombowskie, siła jonowa, bariera elektrostatyczna, moment dipolowy, oddziaływanie dwuwarstwowe, oddziaływania hydrofobowe/hydrofilowe, wiązania wodorowe, teoria termodynamiczna,
dc.titlepl
Mechanizm generowania biofilmu ze szczególnym uwzględnieniem sił van der Waalsa oraz elektrostatycznych
dc.title.alternativepl
Mechanism of biofilm formation with special emphasis on van der Waals and electrostatic forces
dc.typepl
licenciate
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
15
Views per month
Views per city
Krakow
3
Warsaw
2
Wroclaw
2
Ghent
1
Kaohsiung
1
Lębork
1
Prudnik
1
Sochaczew
1
Tarnowskie Góry
1

No access

No Thumbnail Available