Optymalizacja i charakterystyka metody diagnostycznej służącej do identyfikacji podłoża zapalnego chorób stawów

master
dc.abstract.enDiagnostic plays a key role in selection of a proper and effective treatment for a disease. In the case of distinguishing between different types of arthritis, the efficacy of utilized methods is not sufficient enough. It results in misdiagnose and provides inappropriate treatment which leads to lack of recovery from the disease. The most problematic to diagnose among arthritis are joint inflammations associated with autoimmune disorders or infections. This study focused on development of new method for detection of bacterium in blood and synovial samples that is based on i) variation of PCR technique – so called Nasted PCR, together with specially designed universal primers, which recognize coding sequence of bacterial 16 S ribosome subunit and ii) usage of separated fractions of PMNs and PBMCs from patient materials. It was possible to establish conditions sensitive enough to find bacterial prints in human donor samples. Preliminary analysis of patient blood and synovial fluid samples with diagnosed RA showed the potential usage of this method as diagnostic tool to determine more effectively the reason of joint inflammation. Additionally, in this study we showed the possibility of detecting intracellular bacteria among separated subpopulation of immune cells.pl
dc.abstract.plDiagnostyka jest podstawą doboru prawidłowego i efektywnego leczenia. W przypadku chorób stawów obecnie stosowane metody diagnostyczne nie są wystarczająco skuteczne. Największy problem do rozróżnienia stanowią infekcyjne choroby zapalne spowodowane przez bakterie wewnątrzkomórkowe oraz chroniczne stany zapalne o podłożu autoimmunizacyjnym. W tej pracy scharakteryzowano i opisano metodę, która mogłaby w przyszłości zastąpić stosowane dotychczas diagnostyczne metody biochemiczne i posiewowe. Metoda ta opiera się na: i) zmodyfikowanej technice PCR – „Nested PCR” i odpowiednio zaprojektowanym uniwersalnym starterom, które rozpoznają bakteryjną podjednostkę rybosomu 16 S oraz ii) na zastosowaniu do analizy zamiast pełnej krwii lub płynu stawowego oczyszczonych granulocytów (PMNs) i komórek jednojądrzastych (PBMCs). Zoptymalizowane warunki reakcji PCR pozwoliły na identyfikację bakterii powodujących stan zapalny stawu w próbkach pobranych od dawców. Ponadto, wstępna analiza materiału od pacjentów ze zdiagnozowanym reumatoidalnym zapaleniem stawów ukazała potencjalną możliwość wykorzystania tej metody do bardziej skutecznej diagnozy podłoża stanu zapalnego w stawach. Dodatkowo, w pracy tej pokazano, iż możliwa jest detekcja bakterii wewnątrzkomórkowych w obrębie jednej wyizolowanej subpopulacji komórkowej.pl
dc.affiliationWydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologiipl
dc.areaobszar nauk przyrodniczychpl
dc.contributor.advisorCichy, Joanna - 127573 pl
dc.contributor.authorBorek, Zuzannapl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WBBBpl
dc.contributor.reviewerPyrć, Krzysztof - 161470 pl
dc.contributor.reviewerCichy, Joanna - 127573 pl
dc.date.accessioned2020-07-24T16:19:43Z
dc.date.available2020-07-24T16:19:43Z
dc.date.submitted2013-06-25pl
dc.fieldofstudybiotechnologiapl
dc.identifier.apddiploma-74960-97807pl
dc.identifier.projectAPD / Opl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/187780
dc.languagepolpl
dc.source.integratorfalse
dc.subject.enNested PCR, arthritis, diagnosticspl
dc.subject.plNested PCR, zapalenie stawów, diagnostykapl
dc.titleOptymalizacja i charakterystyka metody diagnostycznej służącej do identyfikacji podłoża zapalnego chorób stawówpl
dc.title.alternativeOptimization and characterization of diagnostic technique for different types of joint arthritispl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
Diagnostic plays a key role in selection of a proper and effective treatment for a disease. In the case of distinguishing between different types of arthritis, the efficacy of utilized methods is not sufficient enough. It results in misdiagnose and provides inappropriate treatment which leads to lack of recovery from the disease. The most problematic to diagnose among arthritis are joint inflammations associated with autoimmune disorders or infections. This study focused on development of new method for detection of bacterium in blood and synovial samples that is based on i) variation of PCR technique – so called Nasted PCR, together with specially designed universal primers, which recognize coding sequence of bacterial 16 S ribosome subunit and ii) usage of separated fractions of PMNs and PBMCs from patient materials. It was possible to establish conditions sensitive enough to find bacterial prints in human donor samples. Preliminary analysis of patient blood and synovial fluid samples with diagnosed RA showed the potential usage of this method as diagnostic tool to determine more effectively the reason of joint inflammation. Additionally, in this study we showed the possibility of detecting intracellular bacteria among separated subpopulation of immune cells.
dc.abstract.plpl
Diagnostyka jest podstawą doboru prawidłowego i efektywnego leczenia. W przypadku chorób stawów obecnie stosowane metody diagnostyczne nie są wystarczająco skuteczne. Największy problem do rozróżnienia stanowią infekcyjne choroby zapalne spowodowane przez bakterie wewnątrzkomórkowe oraz chroniczne stany zapalne o podłożu autoimmunizacyjnym. W tej pracy scharakteryzowano i opisano metodę, która mogłaby w przyszłości zastąpić stosowane dotychczas diagnostyczne metody biochemiczne i posiewowe. Metoda ta opiera się na: i) zmodyfikowanej technice PCR – „Nested PCR” i odpowiednio zaprojektowanym uniwersalnym starterom, które rozpoznają bakteryjną podjednostkę rybosomu 16 S oraz ii) na zastosowaniu do analizy zamiast pełnej krwii lub płynu stawowego oczyszczonych granulocytów (PMNs) i komórek jednojądrzastych (PBMCs). Zoptymalizowane warunki reakcji PCR pozwoliły na identyfikację bakterii powodujących stan zapalny stawu w próbkach pobranych od dawców. Ponadto, wstępna analiza materiału od pacjentów ze zdiagnozowanym reumatoidalnym zapaleniem stawów ukazała potencjalną możliwość wykorzystania tej metody do bardziej skutecznej diagnozy podłoża stanu zapalnego w stawach. Dodatkowo, w pracy tej pokazano, iż możliwa jest detekcja bakterii wewnątrzkomórkowych w obrębie jednej wyizolowanej subpopulacji komórkowej.
dc.affiliationpl
Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
dc.areapl
obszar nauk przyrodniczych
dc.contributor.advisorpl
Cichy, Joanna - 127573
dc.contributor.authorpl
Borek, Zuzanna
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WBBB
dc.contributor.reviewerpl
Pyrć, Krzysztof - 161470
dc.contributor.reviewerpl
Cichy, Joanna - 127573
dc.date.accessioned
2020-07-24T16:19:43Z
dc.date.available
2020-07-24T16:19:43Z
dc.date.submittedpl
2013-06-25
dc.fieldofstudypl
biotechnologia
dc.identifier.apdpl
diploma-74960-97807
dc.identifier.projectpl
APD / O
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/187780
dc.languagepl
pol
dc.source.integrator
false
dc.subject.enpl
Nested PCR, arthritis, diagnostics
dc.subject.plpl
Nested PCR, zapalenie stawów, diagnostyka
dc.titlepl
Optymalizacja i charakterystyka metody diagnostycznej służącej do identyfikacji podłoża zapalnego chorób stawów
dc.title.alternativepl
Optimization and characterization of diagnostic technique for different types of joint arthritis
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
10
Views per month
Views per city
Wroclaw
2
Dublin
1
Kicin
1
Lublin
1
Milan
1
Warsaw
1

No access

No Thumbnail Available