Wpływ obniżonego poziomu tlenu na powstawanie i naprawę pojedynczych pęknięć nici DNA indukowanych niebieskim światłem widzialnym

master
dc.abstract.enIt is known that both blue and green light can induce DNA damage. DNA repair protein XRCC1 is the marker of single strand breaks (SSB). We proved that laser beam (488 nm) can cause an accumulation of XRCC1 in the damaged region. Furthermore it suggests that during irradiation of genetic material, single strand breaks occur. The chance of recruiting XRCC1 in normal conditions, after blue light irradiation for 1, 0.5, 0.25 and 0.1 sec is respectively 92%, 58%, 41% and 26%. We analyzed the effects of hypoxia on the XRCC1 accumulation and SSBs occurrences. We found out that chance of inducing XRCC1 recruitment by blue light under hypoxic conditions for the exposure times of 1, 0.5, 0.25 and 0.1 sec decreases respectively by 22, 33, 28 and 15 percentage points. We compared two ways of quantitative evaluation of XRCC1 accumulation. The method that allows to more accurately determine this, is the one which is based on measuring changes within the area with certain minimum fluorescence. This approach also allows to measure the area of the XRCC1 foci and to get to know simplified kinetics of SSB repair.pl
dc.abstract.plUważa się, że światło niebieskie i zielone może oddziaływać na DNA i prowadzić do powstawania pojedynczych pęknięć nici DNA (SSB). Białko naprawcze XRCC1 jest markerem tego typu uszkodzeń. Pokazane w tej pracy badania potwierdzają, że punktowe oddziaływanie wiązki promieni lasera (488 nm) indukuje gromadzenie XRCC1 w miejscu naświetlania, co sugeruje powstawanie SSBs. Podczas oddziaływania na materiał genetyczny światłem niebieskim przez 1, 0,5, 0,25, i 0,1 s szansa na akumulację białka XRCC1, w warunkach normoksji, wynosi odpowiednio 92%, 58%, 41% i 26%. Przeanalizowano także wpływ hipoksji na gromadzenie protein XRCC1 i powstawania pojedynczych pęknięć nici DNA. Szansa na powstanie uszkodzenia pod wpływem działania światła 488 nm, w warunkach hipoksji, dla czasu naświetlania 1, 0,5, 0,25 i 0,1 s spada kolejno o 22, 33, 28 i 15 p.p. Porównano także dwa sposoby ilościowej oceny gromadzenia białka naprawczego XRCC1 i stwierdzono, że metoda polegająca na pomiarze zmiany powierzchni o określonej minimalnej intensywności fluorescencji pozwala na dokładniejsze określenie, czy następuje akumulacja białek naprawczych, pomiar powierzchni ognisk XRCC1 i poznanie zarysu kinetyki procesu naprawy SSB.pl
dc.affiliationWydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologiipl
dc.areaobszar nauk przyrodniczychpl
dc.contributor.advisorZarębski, Mirosław - 162155 pl
dc.contributor.authorPelczar, Martapl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WBBBpl
dc.contributor.reviewerZarębski, Mirosław - 162155 pl
dc.contributor.reviewerWiśniewska-Becker, Anna - 132653 pl
dc.date.accessioned2020-07-27T03:37:15Z
dc.date.available2020-07-27T03:37:15Z
dc.date.submitted2016-10-28pl
dc.fieldofstudybiochemiapl
dc.identifier.apddiploma-110834-97976pl
dc.identifier.projectAPD / Opl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/216797
dc.languagepolpl
dc.source.integratorfalse
dc.subject.en488 nm, blue light, DNA damages, hypoxia, SSB, XRCC1pl
dc.subject.pl488 nm, hipoksja, SSB, światło niebieskie, uszkodzenia DNA, XRCC1pl
dc.titleWpływ obniżonego poziomu tlenu na powstawanie i naprawę pojedynczych pęknięć nici DNA indukowanych niebieskim światłem widzialnympl
dc.title.alternativeInfluence of hypoxia on DNA single strand breaks induction and repair, introduced by visible blue lightpl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
It is known that both blue and green light can induce DNA damage. DNA repair protein XRCC1 is the marker of single strand breaks (SSB). We proved that laser beam (488 nm) can cause an accumulation of XRCC1 in the damaged region. Furthermore it suggests that during irradiation of genetic material, single strand breaks occur. The chance of recruiting XRCC1 in normal conditions, after blue light irradiation for 1, 0.5, 0.25 and 0.1 sec is respectively 92%, 58%, 41% and 26%. We analyzed the effects of hypoxia on the XRCC1 accumulation and SSBs occurrences. We found out that chance of inducing XRCC1 recruitment by blue light under hypoxic conditions for the exposure times of 1, 0.5, 0.25 and 0.1 sec decreases respectively by 22, 33, 28 and 15 percentage points. We compared two ways of quantitative evaluation of XRCC1 accumulation. The method that allows to more accurately determine this, is the one which is based on measuring changes within the area with certain minimum fluorescence. This approach also allows to measure the area of the XRCC1 foci and to get to know simplified kinetics of SSB repair.
dc.abstract.plpl
Uważa się, że światło niebieskie i zielone może oddziaływać na DNA i prowadzić do powstawania pojedynczych pęknięć nici DNA (SSB). Białko naprawcze XRCC1 jest markerem tego typu uszkodzeń. Pokazane w tej pracy badania potwierdzają, że punktowe oddziaływanie wiązki promieni lasera (488 nm) indukuje gromadzenie XRCC1 w miejscu naświetlania, co sugeruje powstawanie SSBs. Podczas oddziaływania na materiał genetyczny światłem niebieskim przez 1, 0,5, 0,25, i 0,1 s szansa na akumulację białka XRCC1, w warunkach normoksji, wynosi odpowiednio 92%, 58%, 41% i 26%. Przeanalizowano także wpływ hipoksji na gromadzenie protein XRCC1 i powstawania pojedynczych pęknięć nici DNA. Szansa na powstanie uszkodzenia pod wpływem działania światła 488 nm, w warunkach hipoksji, dla czasu naświetlania 1, 0,5, 0,25 i 0,1 s spada kolejno o 22, 33, 28 i 15 p.p. Porównano także dwa sposoby ilościowej oceny gromadzenia białka naprawczego XRCC1 i stwierdzono, że metoda polegająca na pomiarze zmiany powierzchni o określonej minimalnej intensywności fluorescencji pozwala na dokładniejsze określenie, czy następuje akumulacja białek naprawczych, pomiar powierzchni ognisk XRCC1 i poznanie zarysu kinetyki procesu naprawy SSB.
dc.affiliationpl
Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
dc.areapl
obszar nauk przyrodniczych
dc.contributor.advisorpl
Zarębski, Mirosław - 162155
dc.contributor.authorpl
Pelczar, Marta
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WBBB
dc.contributor.reviewerpl
Zarębski, Mirosław - 162155
dc.contributor.reviewerpl
Wiśniewska-Becker, Anna - 132653
dc.date.accessioned
2020-07-27T03:37:15Z
dc.date.available
2020-07-27T03:37:15Z
dc.date.submittedpl
2016-10-28
dc.fieldofstudypl
biochemia
dc.identifier.apdpl
diploma-110834-97976
dc.identifier.projectpl
APD / O
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/216797
dc.languagepl
pol
dc.source.integrator
false
dc.subject.enpl
488 nm, blue light, DNA damages, hypoxia, SSB, XRCC1
dc.subject.plpl
488 nm, hipoksja, SSB, światło niebieskie, uszkodzenia DNA, XRCC1
dc.titlepl
Wpływ obniżonego poziomu tlenu na powstawanie i naprawę pojedynczych pęknięć nici DNA indukowanych niebieskim światłem widzialnym
dc.title.alternativepl
Influence of hypoxia on DNA single strand breaks induction and repair, introduced by visible blue light
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
11
Views per month
Views per city
Dublin
2
Krakow
2
Warsaw
2
Wroclaw
2
Iwanowice
1
Włocławek
1

No access

No Thumbnail Available