Otrzymywanie przeciwciał specyficznych względem białka MCPIP2

master
dc.abstract.enThe MCPIP2 protein is the most obscure member of the MCPIP family. It has been observed that MCPIP2 is temporarily inactivated by pro-inflammatory factors. This was observed in cells overexpressing MCPIP2 and it needs to be confirmed on the endogenous protein. In the absence of commercially available antibodies recognising the MCPIP2 protein, it is crucial to obtain MCPIP2-specific antibodies, which was attempted in this study.The hybridoma technique was used to obtain the antibodies. I began with the production of an antigen indispensable for the immunization of mice. For this purpose, a construct was created to express the antigen (recombinant protein hereafter referred to as M2Ag), consisting of short fragments of the MCPIP2 protein and glycine-serine linkers, in a bacterial expression system. Once the construct was obtained, it was introduced into E. coli bacteria strain BL21(DE3) and preliminary expression assays were performed. Once protein production was confirmed, the bacterial culture conditions were optimised so that protein expression would be the highest attainable. Despite optimisation and attempts to change the lysis conditions, the M2Ag protein was predominantly present in the insoluble fraction - the so-called inclusion bodies. This resulted in the need to dissolve the inclusion bodies and necessitated performing the purification procedures under denaturing conditions. Owing to the presence of two different tags at both ends of the protein, using purification by two-step affinity chromatography was possible. The histidine tag (10xHis) was used in the initial purification, and subsequently the protein was purified using the Twin-Strep-tag. The preparations thus obtained were of high purity and after dialysis and concentration were used to immunize 4 mice.The presence of antibodies recognising M2Ag in the sera of immunized mice was confirmed by ELISA. After selection of one of the mice, fusion of splenocytes with myeloma cells was performed and the culture media of the resulting hybridoma cells were tested for antigen-specific antibodies. The preliminary results indicate the success of this procedure. Furthermore, the serum from the selected mouse recognises not only the antigen but also the MCPIP2 protein, as confirmed by Western Blot analysis performed on lysates from a human cell line overexpressing the MCPIP2 protein.pl
dc.abstract.plBiałko MCPIP2 jest najsłabiej poznanym członkiem rodziny MCPIP. Zaobserwowano, że MCPIP2 ulega czasowej inaktywacji wskutek działania czynników prozapalnych. Obserwacje te wykonane były na komórkach z nadekspresją MCPIP2 i wymagają potwierdzenia na białku endogennym. Wobec braku komercyjnie dostępnych przeciwciał rozpoznających białko MCPIP2, kluczowe jest uzyskanie przeciwciał specyficznych względem tego białka, czego próbę podjęto w niniejszej pracy.Do uzyskania przeciwciał wykorzystano technikę hybrydoma. Rozpoczęto od produkcji antygenu niezbędnego do immunizacji myszy. W tym celu stworzono konstrukt pozwalający na ekspresję antygenu (białka rekombinowanego określanego dalej jako M2Ag) złożonego z krótkich fragmentów białka MCPIP2 i łączników glicynowo‑serynowych, w bakteryjnym systemie ekspresyjnym. Po uzyskaniu konstruktu wprowadzono go do bakterii E. coli szczepu BL21(DE3) i wykonano wstępne testy ekspresji. Po potwierdzeniu produkcji białka zoptymalizowano warunki hodowli bakterii tak, aby ekspresja białka była jak najwyższa. Pomimo optymalizacji i prób zmiany warunków lizy białko M2Ag obecne było w przeważającej ilości we frakcji nierozpuszczalnej – tzw. ciałkach inkluzyjnych. Spowodowało to konieczność rozpuszczania ciałek inkluzyjnych i wymusiło przeprowadzenie procedur oczyszczania w warunkach denaturujących. Dzięki obecności dwóch różnych metek na obu końcach białka możliwe było oczyszczanie z wykorzystaniem dwuetapowej chromatografii powinowactwa. We wstępnym oczyszczaniu wykorzystano metkę histydynową (10xHis), a następnie białko doczyszczono wykorzystując metkę Twin-Strep-tag. Tak uzyskane preparaty charakteryzowały się wysokim stopniem czystości i po dializie oraz zagęszczeniu zostały użyte do immunizacji 4 myszy.Obecność przeciwciał rozpoznających M2Ag w surowicach immunizowanych myszy potwierdzono testami ELISA. Po wyborze jednej z myszy przeprowadzono fuzję splenocytów z komórkami szpiczaka, a pożywki znad hodowli powstałych komórek hybrydoma testowano na obecność przeciwciał specyficznych względem antygenu. Wstępne wyniki wskazują na powodzenie tej procedury. Ponadto, surowica wybranej myszy rozpoznaje nie tylko antygen, ale również białko MCPIP2, co potwierdzono metodą Western Blot wykonaną na lizatach z ludzkiej linii komórkowej z nadekspresją białka MCPIP2.pl
dc.affiliationWydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologiipl
dc.areaobszar nauk przyrodniczychpl
dc.contributor.advisorWawro, Mateuszpl
dc.contributor.authorKurzejamska, Zuzannapl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WBBBpl
dc.contributor.reviewerWawro, Mateuszpl
dc.contributor.reviewerKędracka-Krok, Sylwia - 128739 pl
dc.date.accessioned2021-06-28T21:41:05Z
dc.date.available2021-06-28T21:41:05Z
dc.date.submitted2021-06-28pl
dc.fieldofstudybiotechnologia molekularnapl
dc.identifier.apddiploma-150785-227655pl
dc.identifier.projectAPD / Opl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/275238
dc.languagepolpl
dc.subject.enMCPIP2, antibody production, protein purification, hybridoma technology, immunization, optimization of bacterial culturespl
dc.subject.plMCPIP2, produkcja przeciwciał, oczyszczanie białek, technika hybrydoma, immunizacja, optymalizacja hodowli bakteryjnychpl
dc.titleOtrzymywanie przeciwciał specyficznych względem białka MCPIP2pl
dc.title.alternativeProduction of MCPIP2 protein-specific antibodiespl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
The MCPIP2 protein is the most obscure member of the MCPIP family. It has been observed that MCPIP2 is temporarily inactivated by pro-inflammatory factors. This was observed in cells overexpressing MCPIP2 and it needs to be confirmed on the endogenous protein. In the absence of commercially available antibodies recognising the MCPIP2 protein, it is crucial to obtain MCPIP2-specific antibodies, which was attempted in this study.The hybridoma technique was used to obtain the antibodies. I began with the production of an antigen indispensable for the immunization of mice. For this purpose, a construct was created to express the antigen (recombinant protein hereafter referred to as M2Ag), consisting of short fragments of the MCPIP2 protein and glycine-serine linkers, in a bacterial expression system. Once the construct was obtained, it was introduced into E. coli bacteria strain BL21(DE3) and preliminary expression assays were performed. Once protein production was confirmed, the bacterial culture conditions were optimised so that protein expression would be the highest attainable. Despite optimisation and attempts to change the lysis conditions, the M2Ag protein was predominantly present in the insoluble fraction - the so-called inclusion bodies. This resulted in the need to dissolve the inclusion bodies and necessitated performing the purification procedures under denaturing conditions. Owing to the presence of two different tags at both ends of the protein, using purification by two-step affinity chromatography was possible. The histidine tag (10xHis) was used in the initial purification, and subsequently the protein was purified using the Twin-Strep-tag. The preparations thus obtained were of high purity and after dialysis and concentration were used to immunize 4 mice.The presence of antibodies recognising M2Ag in the sera of immunized mice was confirmed by ELISA. After selection of one of the mice, fusion of splenocytes with myeloma cells was performed and the culture media of the resulting hybridoma cells were tested for antigen-specific antibodies. The preliminary results indicate the success of this procedure. Furthermore, the serum from the selected mouse recognises not only the antigen but also the MCPIP2 protein, as confirmed by Western Blot analysis performed on lysates from a human cell line overexpressing the MCPIP2 protein.
dc.abstract.plpl
Białko MCPIP2 jest najsłabiej poznanym członkiem rodziny MCPIP. Zaobserwowano, że MCPIP2 ulega czasowej inaktywacji wskutek działania czynników prozapalnych. Obserwacje te wykonane były na komórkach z nadekspresją MCPIP2 i wymagają potwierdzenia na białku endogennym. Wobec braku komercyjnie dostępnych przeciwciał rozpoznających białko MCPIP2, kluczowe jest uzyskanie przeciwciał specyficznych względem tego białka, czego próbę podjęto w niniejszej pracy.Do uzyskania przeciwciał wykorzystano technikę hybrydoma. Rozpoczęto od produkcji antygenu niezbędnego do immunizacji myszy. W tym celu stworzono konstrukt pozwalający na ekspresję antygenu (białka rekombinowanego określanego dalej jako M2Ag) złożonego z krótkich fragmentów białka MCPIP2 i łączników glicynowo‑serynowych, w bakteryjnym systemie ekspresyjnym. Po uzyskaniu konstruktu wprowadzono go do bakterii E. coli szczepu BL21(DE3) i wykonano wstępne testy ekspresji. Po potwierdzeniu produkcji białka zoptymalizowano warunki hodowli bakterii tak, aby ekspresja białka była jak najwyższa. Pomimo optymalizacji i prób zmiany warunków lizy białko M2Ag obecne było w przeważającej ilości we frakcji nierozpuszczalnej – tzw. ciałkach inkluzyjnych. Spowodowało to konieczność rozpuszczania ciałek inkluzyjnych i wymusiło przeprowadzenie procedur oczyszczania w warunkach denaturujących. Dzięki obecności dwóch różnych metek na obu końcach białka możliwe było oczyszczanie z wykorzystaniem dwuetapowej chromatografii powinowactwa. We wstępnym oczyszczaniu wykorzystano metkę histydynową (10xHis), a następnie białko doczyszczono wykorzystując metkę Twin-Strep-tag. Tak uzyskane preparaty charakteryzowały się wysokim stopniem czystości i po dializie oraz zagęszczeniu zostały użyte do immunizacji 4 myszy.Obecność przeciwciał rozpoznających M2Ag w surowicach immunizowanych myszy potwierdzono testami ELISA. Po wyborze jednej z myszy przeprowadzono fuzję splenocytów z komórkami szpiczaka, a pożywki znad hodowli powstałych komórek hybrydoma testowano na obecność przeciwciał specyficznych względem antygenu. Wstępne wyniki wskazują na powodzenie tej procedury. Ponadto, surowica wybranej myszy rozpoznaje nie tylko antygen, ale również białko MCPIP2, co potwierdzono metodą Western Blot wykonaną na lizatach z ludzkiej linii komórkowej z nadekspresją białka MCPIP2.
dc.affiliationpl
Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
dc.areapl
obszar nauk przyrodniczych
dc.contributor.advisorpl
Wawro, Mateusz
dc.contributor.authorpl
Kurzejamska, Zuzanna
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WBBB
dc.contributor.reviewerpl
Wawro, Mateusz
dc.contributor.reviewerpl
Kędracka-Krok, Sylwia - 128739
dc.date.accessioned
2021-06-28T21:41:05Z
dc.date.available
2021-06-28T21:41:05Z
dc.date.submittedpl
2021-06-28
dc.fieldofstudypl
biotechnologia molekularna
dc.identifier.apdpl
diploma-150785-227655
dc.identifier.projectpl
APD / O
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/275238
dc.languagepl
pol
dc.subject.enpl
MCPIP2, antibody production, protein purification, hybridoma technology, immunization, optimization of bacterial cultures
dc.subject.plpl
MCPIP2, produkcja przeciwciał, oczyszczanie białek, technika hybrydoma, immunizacja, optymalizacja hodowli bakteryjnych
dc.titlepl
Otrzymywanie przeciwciał specyficznych względem białka MCPIP2
dc.title.alternativepl
Production of MCPIP2 protein-specific antibodies
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
35
Views per month
Views per city
Krakow
5
Dublin
3
Sanok
3
Wroclaw
3
Warsaw
2
Bolesławiec
1
Gdynia
1
Katowice
1
Kętrzyn
1
Poznan
1

No access

No Thumbnail Available