Syntesis of 1H-benzo[d]imidazole derivatives as potential GABA-A receptor ligands

master
dc.abstract.enThe basal ganglia abnormalities are characteristic for various neurological disorders, such as Parkinson’s disease, dystonias, dyskinesias and post-stroke apathy. Recent clinical data suggests that the modulation of GABA-A receptors representing the α1β2γ2 subpopulation, expressed typically in the area of basal ganglia, could be a promising therapeutic strategy for those disorders. However, the chemical space of GABA-A receptor modulators targeting the α1/γ2 interface is currently limited to the derivatives of imidazo[1,2-a]pyridine, which is a moiety undergoing a rapid metabolic transformation. That is why novel chemical entities, mimicking the properties of imidazo[1,2-a]pyridine, were designed. A library of 2-(4-fluorophenyl)-1H-benzo[d]imidazoles was synthesized. The main strategies employed in the molecule design included changing the molecule core, blocking the metabolic hot spot by substituting the methyl group with a fluorine atom, and investigating the significance of the methyl group's position at the 6-position for GABA-A receptor recognition. Four-step synthesis allowed to obtain new positive allosteric modulators of GABA-A receptor, amongst which the molecule 4B showed the most promising properties. Molecule 4B was further tested in radioligand binding, electrophysiology and thermodynamic solubility assays. It was proven to display interesting properties: the preferential α1/γ2 binding and positive allosteric modulation of GABA-A receptor. This work allowed to broaden the chemical space of possible ligands targeting the α1/γ2 GABA-A receptor interface, allowing to better probe and test this exact biological target in the future.pl
dc.abstract.plNieprawidłowości w rejonie jąder podstawnych są charakterystyczne dla wielu schorzeń neurologicznych, takich jak choroba Parkinsona, dystonie, dyskinezje czy apatia poudarowa. Dane kliniczne sugerują, że modulacja receptorów GABA-A z subpopulacji α1β2γ2, których ekspresja jest typowa dla rejonu jąder podstawnych, mogłaby być obiecującą strategią terapeutyczną w powyższych schorzeniach. Jednakże, modulatory receptora GABA-A celujące konkretnie w przestrzeń α1/γ2 ograniczają się obecnie do pochodnych imidazo[1,2-a]pirydyny, która podlega szybkim przemianom metabolicznym. Z tego powodu zaprojektowane zostały nowe cząsteczki, naśladujące właściwości imidazo[1,2-a]pirydyny. Przeprowadzono syntezę pochodnych 2-(4-fluorofenylo)-1H-benz[d]imidazolu, w których został zmieniony rdzeń cząsteczki, zablokowano hot spot metaboliczny oraz zbadano istotność położenia grupy metylowej w pozycji 6 układu heteroaromatycznego dla rozpoznania receptora GABA-A. 4-etapowa synteza pozwoliła na otrzymanie nowych pozytywnych allosterycznych modulatorów receptora GABA-A, spośród których cząsteczka 4B wykazała najbardziej obiecujące właściwości. Zbadano rozpuszczalność termodynamiczną dla cząsteczki 4B. Cząsteczka 4B okazała się wiązać preferencyjnie w przestrzeni α1/γ2. Wykazała się też pozytywną allosteryczną modulacją receptora GABA-A. Praca pozwoliła na poszerzenie biblioteki związków celujących w przestrzeń α1/γ2 receptora GABA-A.pl
dc.affiliationWydział Farmaceutycznypl
dc.areaobszar nauk medycznych, nauk o zdrowiu oraz nauk o kulturze fizycznejpl
dc.contributor.advisorMarcinkowska, Monikapl
dc.contributor.authorSzafrańska, Katarzynapl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WFOAM2pl
dc.contributor.reviewerKołaczkowski, Marcin - 130216 pl
dc.contributor.reviewerMarcinkowska, Monikapl
dc.date.accessioned2023-07-13T21:37:47Z
dc.date.available2023-07-13T21:37:47Z
dc.date.submitted2023-07-12pl
dc.fieldofstudyDrug Discovery and Developmentpl
dc.identifier.apddiploma-163523-259368pl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/316207
dc.languageengpl
dc.subject.en1H-benzo[d]imidazole, GABA-A receptor, positive allosteric modulator, benzodiazepine, zolpidempl
dc.subject.pl1H-benz[d]imidazol, receptor GABA-A, pozytywny modulator allosteryczny, benzodiazepiny, zolpidempl
dc.titleSyntesis of 1H-benzo[d]imidazole derivatives as potential GABA-A receptor ligandspl
dc.title.alternativeSynteza pochodnych 1H-benz[d]imidazolu jako potencjalnych ligandów receptora GABA-Apl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
The basal ganglia abnormalities are characteristic for various neurological disorders, such as Parkinson’s disease, dystonias, dyskinesias and post-stroke apathy. Recent clinical data suggests that the modulation of GABA-A receptors representing the α1β2γ2 subpopulation, expressed typically in the area of basal ganglia, could be a promising therapeutic strategy for those disorders. However, the chemical space of GABA-A receptor modulators targeting the α1/γ2 interface is currently limited to the derivatives of imidazo[1,2-a]pyridine, which is a moiety undergoing a rapid metabolic transformation. That is why novel chemical entities, mimicking the properties of imidazo[1,2-a]pyridine, were designed. A library of 2-(4-fluorophenyl)-1H-benzo[d]imidazoles was synthesized. The main strategies employed in the molecule design included changing the molecule core, blocking the metabolic hot spot by substituting the methyl group with a fluorine atom, and investigating the significance of the methyl group's position at the 6-position for GABA-A receptor recognition. Four-step synthesis allowed to obtain new positive allosteric modulators of GABA-A receptor, amongst which the molecule 4B showed the most promising properties. Molecule 4B was further tested in radioligand binding, electrophysiology and thermodynamic solubility assays. It was proven to display interesting properties: the preferential α1/γ2 binding and positive allosteric modulation of GABA-A receptor. This work allowed to broaden the chemical space of possible ligands targeting the α1/γ2 GABA-A receptor interface, allowing to better probe and test this exact biological target in the future.
dc.abstract.plpl
Nieprawidłowości w rejonie jąder podstawnych są charakterystyczne dla wielu schorzeń neurologicznych, takich jak choroba Parkinsona, dystonie, dyskinezje czy apatia poudarowa. Dane kliniczne sugerują, że modulacja receptorów GABA-A z subpopulacji α1β2γ2, których ekspresja jest typowa dla rejonu jąder podstawnych, mogłaby być obiecującą strategią terapeutyczną w powyższych schorzeniach. Jednakże, modulatory receptora GABA-A celujące konkretnie w przestrzeń α1/γ2 ograniczają się obecnie do pochodnych imidazo[1,2-a]pirydyny, która podlega szybkim przemianom metabolicznym. Z tego powodu zaprojektowane zostały nowe cząsteczki, naśladujące właściwości imidazo[1,2-a]pirydyny. Przeprowadzono syntezę pochodnych 2-(4-fluorofenylo)-1H-benz[d]imidazolu, w których został zmieniony rdzeń cząsteczki, zablokowano hot spot metaboliczny oraz zbadano istotność położenia grupy metylowej w pozycji 6 układu heteroaromatycznego dla rozpoznania receptora GABA-A. 4-etapowa synteza pozwoliła na otrzymanie nowych pozytywnych allosterycznych modulatorów receptora GABA-A, spośród których cząsteczka 4B wykazała najbardziej obiecujące właściwości. Zbadano rozpuszczalność termodynamiczną dla cząsteczki 4B. Cząsteczka 4B okazała się wiązać preferencyjnie w przestrzeni α1/γ2. Wykazała się też pozytywną allosteryczną modulacją receptora GABA-A. Praca pozwoliła na poszerzenie biblioteki związków celujących w przestrzeń α1/γ2 receptora GABA-A.
dc.affiliationpl
Wydział Farmaceutyczny
dc.areapl
obszar nauk medycznych, nauk o zdrowiu oraz nauk o kulturze fizycznej
dc.contributor.advisorpl
Marcinkowska, Monika
dc.contributor.authorpl
Szafrańska, Katarzyna
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WFOAM2
dc.contributor.reviewerpl
Kołaczkowski, Marcin - 130216
dc.contributor.reviewerpl
Marcinkowska, Monika
dc.date.accessioned
2023-07-13T21:37:47Z
dc.date.available
2023-07-13T21:37:47Z
dc.date.submittedpl
2023-07-12
dc.fieldofstudypl
Drug Discovery and Development
dc.identifier.apdpl
diploma-163523-259368
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/316207
dc.languagepl
eng
dc.subject.enpl
1H-benzo[d]imidazole, GABA-A receptor, positive allosteric modulator, benzodiazepine, zolpidem
dc.subject.plpl
1H-benz[d]imidazol, receptor GABA-A, pozytywny modulator allosteryczny, benzodiazepiny, zolpidem
dc.titlepl
Syntesis of 1H-benzo[d]imidazole derivatives as potential GABA-A receptor ligands
dc.title.alternativepl
Synteza pochodnych 1H-benz[d]imidazolu jako potencjalnych ligandów receptora GABA-A
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
12
Views per month
Views per city
Krakow
6
Pune
2
Warsaw
2
Gmina Strzelin
1
São Paulo
1

No access

No Thumbnail Available
Collections