Wyciszenie ekspresji białka GARP w unieśmiertelnionej linii komórkowej ludzkiego śródbłonka naczyń limfatycznych, za pomocą wektorów lentiwirusowych kodujących specyficzne dla GARP shRNA

licenciate
dc.abstract.enGARP is a transmembrane protein involved in the binding of the latent form of TGFβ, LAP-TGF-β to the cell surface. It might be used as a potential target for new anti-cancer therapies. The goal of the current work was to silence the expression of GARP protein on the surface of human lymphatic endothelial cell line (hiLEC). This modified cell line, will be used to study the role of GARP in the regulation of the immune response by lymphatic endothelium. To silence the expression, we used lentiviral vectors encoding GARP-specific shRNA. Efficiency of the silencing was checked on two levels, protein and mRNA. The percentage of cells with GARP expression on their surface was evaluated by flow cytometry, whereas the change in the amount of a specific transcript was verified by the real time PCR. Two sublines of hiLECs with significantly decreased GARP expression was obtained. Moreover, using PCR test we confirmed that the obtained cell sublines were not contaminated with mycoplasma.pl
dc.abstract.plGARP to białko transbłonowe typu I, które wiąże na powierzchni komórki nieaktywną formę TGFβ, LAP-TGF-β i pośredniczy w aktywacji tego czynnika wzrostu. Wyniki wielu badań pokazują, iż białko to może być potencjalnym celem nowych terapii antynowotworowych. Tematem bieżącej pracy było wyciszenie ekspresji białka GARP w linii komórkowej ludzkiego śródbłonka naczyń limfatycznych - hiLEC. Tak zmodyfikowana linia ma posłużyć do badania roli białka GARP w regulacji odpowiedzi układu odpornościowego przez komórki śródbłonka naczyń limfatycznych. Do wyciszenia ekspresji białka GARP wykorzystano wektory lentiwirusowe, kodujące specyficzne dla GARP shRNA. Sprawdzenia poziomu wyciszenia dokonano na dwóch poziomach, białka oraz mRNA. Procent komórek wykazujących ekspresje białka GARP wyznaczono techniką cytometrii przepływowej, natomiast zmianę ilości specyficznego transkryptu analizowano przy pomocy reakcji real-time PCR. Otrzymano dwie linie komórkowe, w których ekspresja białka GARP na powierzchni jest znacząco obniżona. Ponadto, za pomocą techniki PCR wykazano, że linie te nie są zakażone mykoplazmą.pl
dc.affiliationWydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologiipl
dc.areaobszar nauk przyrodniczychpl
dc.contributor.advisorMężyk-Kopeć, Renata - 130487 pl
dc.contributor.authorMazur, Angelikapl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WBBBpl
dc.contributor.reviewerMężyk-Kopeć, Renata - 130487 pl
dc.contributor.reviewerCzaplicki, Dominikpl
dc.date.accessioned2020-07-27T17:40:26Z
dc.date.available2020-07-27T17:40:26Z
dc.date.submitted2018-07-05pl
dc.fieldofstudybiotechnologiapl
dc.identifier.apddiploma-125043-214305pl
dc.identifier.projectAPD / Opl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/229293
dc.languagepolpl
dc.subject.enGARP, TGFβ, lentiviral vectors, transduction, shRNA, hiLEC, lymphatic endothelium, silence the expression, cancer, flow cytometry, real-time PCRpl
dc.subject.plGARP, TGFβ, wektory lentiwirusowe, transdukcja, shRNA, hiLEC, śródbłonek limfatyczny, wyciszenie ekspresji, nowotwór, cytometria przepływowa, real-time PCRpl
dc.titleWyciszenie ekspresji białka GARP w unieśmiertelnionej linii komórkowej ludzkiego śródbłonka naczyń limfatycznych, za pomocą wektorów lentiwirusowych kodujących specyficzne dla GARP shRNApl
dc.title.alternativeSilencing of the expression of GARP protein in the human immortalized lymphatic endothelial cell line, using lentiviral vectors encoding GARP shRNA.pl
dc.typelicenciatepl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
GARP is a transmembrane protein involved in the binding of the latent form of TGFβ, LAP-TGF-β to the cell surface. It might be used as a potential target for new anti-cancer therapies. The goal of the current work was to silence the expression of GARP protein on the surface of human lymphatic endothelial cell line (hiLEC). This modified cell line, will be used to study the role of GARP in the regulation of the immune response by lymphatic endothelium. To silence the expression, we used lentiviral vectors encoding GARP-specific shRNA. Efficiency of the silencing was checked on two levels, protein and mRNA. The percentage of cells with GARP expression on their surface was evaluated by flow cytometry, whereas the change in the amount of a specific transcript was verified by the real time PCR. Two sublines of hiLECs with significantly decreased GARP expression was obtained. Moreover, using PCR test we confirmed that the obtained cell sublines were not contaminated with mycoplasma.
dc.abstract.plpl
GARP to białko transbłonowe typu I, które wiąże na powierzchni komórki nieaktywną formę TGFβ, LAP-TGF-β i pośredniczy w aktywacji tego czynnika wzrostu. Wyniki wielu badań pokazują, iż białko to może być potencjalnym celem nowych terapii antynowotworowych. Tematem bieżącej pracy było wyciszenie ekspresji białka GARP w linii komórkowej ludzkiego śródbłonka naczyń limfatycznych - hiLEC. Tak zmodyfikowana linia ma posłużyć do badania roli białka GARP w regulacji odpowiedzi układu odpornościowego przez komórki śródbłonka naczyń limfatycznych. Do wyciszenia ekspresji białka GARP wykorzystano wektory lentiwirusowe, kodujące specyficzne dla GARP shRNA. Sprawdzenia poziomu wyciszenia dokonano na dwóch poziomach, białka oraz mRNA. Procent komórek wykazujących ekspresje białka GARP wyznaczono techniką cytometrii przepływowej, natomiast zmianę ilości specyficznego transkryptu analizowano przy pomocy reakcji real-time PCR. Otrzymano dwie linie komórkowe, w których ekspresja białka GARP na powierzchni jest znacząco obniżona. Ponadto, za pomocą techniki PCR wykazano, że linie te nie są zakażone mykoplazmą.
dc.affiliationpl
Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
dc.areapl
obszar nauk przyrodniczych
dc.contributor.advisorpl
Mężyk-Kopeć, Renata - 130487
dc.contributor.authorpl
Mazur, Angelika
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WBBB
dc.contributor.reviewerpl
Mężyk-Kopeć, Renata - 130487
dc.contributor.reviewerpl
Czaplicki, Dominik
dc.date.accessioned
2020-07-27T17:40:26Z
dc.date.available
2020-07-27T17:40:26Z
dc.date.submittedpl
2018-07-05
dc.fieldofstudypl
biotechnologia
dc.identifier.apdpl
diploma-125043-214305
dc.identifier.projectpl
APD / O
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/229293
dc.languagepl
pol
dc.subject.enpl
GARP, TGFβ, lentiviral vectors, transduction, shRNA, hiLEC, lymphatic endothelium, silence the expression, cancer, flow cytometry, real-time PCR
dc.subject.plpl
GARP, TGFβ, wektory lentiwirusowe, transdukcja, shRNA, hiLEC, śródbłonek limfatyczny, wyciszenie ekspresji, nowotwór, cytometria przepływowa, real-time PCR
dc.titlepl
Wyciszenie ekspresji białka GARP w unieśmiertelnionej linii komórkowej ludzkiego śródbłonka naczyń limfatycznych, za pomocą wektorów lentiwirusowych kodujących specyficzne dla GARP shRNA
dc.title.alternativepl
Silencing of the expression of GARP protein in the human immortalized lymphatic endothelial cell line, using lentiviral vectors encoding GARP shRNA.
dc.typepl
licenciate
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
22
Views per month
Views per city
Wroclaw
4
Krakow
3
Warsaw
2
Bydgoszcz
1
Bytom
1
Dublin
1
Gdansk
1
Jablonna
1
Jelcz Laskowice
1
Poznan
1

No access

No Thumbnail Available