Application of pulsed field gel electrophoresis (PFGE) method for genotyping Staphylococcus epidermidis and S. haemolyticus isolates

Gronkowce koagulazoujemne są obecnie uznawane za jeden z najważniejszych patogenów oportunistycznych. Powodują głównie zakażenia szpitalne, na które szczególnie narażone są przedwcześnie urodzone noworodki o bardzo małej masie urodzeniowej. Do najczęściej występujących zakażeń należą zakażenie krwi oraz zapalenie płuc związane z wentylacją mechaniczną. Do genotypowania gronkowców koagulazoujemnych stosuje się szereg metod, wśród których za złoty standard uznaje się analizę fragmentów restrykcyjnych (REA) za pomocą elektroforezy w zmiennym polu elektrycznym (PFGE). W poniższej pracy przeanalizowano metodą REA-PFGE 133 izolaty należące do gatunku Staphylococcus epidermidis oraz 74 izolaty należące do gatunku S. haemolyticus pochodzące z zakażeń noworodków o bardzo małej masie urodzeniowej oraz wykazano pewne korelacje pomiędzy ich klasyfikacją a dostępnymi danymi epidemiologicznymi oraz danymi dotyczącymi ich antybiotykooporności.

Coagulase-negative staphylococci are nowadays recognized as one of the most important opportunistic pathogens. They cause mostly nosocomial infections, which premature infantis with very low birthweight are particularly vulnerable to. The most common infections iclude bloodstream infection and ventilator-associated pneumonia. There is a number of method used for genotyping of coagulase-negative staphylococci, from which restriction enzyme analysis (REA) by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) is considered as the gold standard. In this study, 133 isolates belonging to species Staphylococcus epidermidis and 74 isolates belonging to species S. haemolyticus, gathered from very low birthweight neonates’ infections, were examined using REA-PFGE method, and some correlations between their classification and the epidemiological data and antibiotic resistance data were proven.