Immobilizacja dehydrogenaz ketosteroidowych z metką histydynową w sieciach metalo- organicznych

master
dc.abstract.enEnzyme immobilization describes the potential process of physically or chemically binding enzymes to a solid substrate. This extremely effective procedure is required for important enzyme applications in medicine, environmental protection and industry. Common supports used for enzyme immobilization include silica, inorganic oxides, biopolymers, and nanoparticles. More and more information is appearing in the literature about the use of metal-organic frameworks for the enzyme binding process. Many traditional strategies that have been used to stabilize enzymes are compatible with the chemistry of MOF-type materials. In addition, the pore dimensions and chemical functionality of MOFs can be optimized to encapsulate the appropriate enzyme to a level of precision that is not achievable with other porous materials, such as zeolites or mesoporous silicas. These properties clearly distinguish metal-organic frameworks to other compounds.The aim of this study was to synthesize biocomposites by surface bond immobilization, in which selected metal-organic frameworks were used as support materials, while the active phase in them was the AcmB-His enzyme. In a view of AcmB-His's high affinity for Ni2+ ions and the presence of 6 histidine tags with -NH2 functional groups in its structure, the study was carried out with Ni-MOF-74 and UiO-66-NH2 structures. Then, after developing the immobilization procedure, the amount of attached protein on the surface of the supports was determined using the Bradford method and the resulting biocomposites were characterized using Powder X-ray Diffractometry (PXRD), Infrared Spectroscopy (IR) and SEM imaging. At the very end, the activity of the biocomposites, in the AcmB-His-specific Δ1-dehydrogenation reaction of one of the compounds of the 3-ketosteroid group, androst-4-ene-3,17-dione (AD) to androst-1,4-dien-3,17-dione (ADD), was tested to determine their catalytic activities and operational stability. The progress of catalytic reactions was observed by using High Performance Liquid Chromatography (HPLC) technique.pl
dc.abstract.plImmobilizacja enzymów opisuje potencjalny proces fizycznego lub chemicznego wiązania enzymów na stałym podłożu. Ta wyjątkowo skuteczna procedura wymagana jest do ważnych zastosowań enzymów w medycynie, ochronie środowiska i przemyśle. Powszechnie do immobilizacji enzymów wykorzystywane są takie nośniki jak: krzemionka, tlenki nieorganiczne, biopolimery, nanocząstki. Coraz więcej pojawia się w literaturze informacji na temat wykorzystaniu sieci metalo-organicznych do procesu wiązania enzymów. Wiele tradycyjnych strategii, które zostały zastosowane do stabilizacji enzymów, są kompatybilne z chemią materiałów typu MOF. Dodatkowo wymiary porów i funkcjonalność chemiczna MOF-ów może zostać zoptymalizowana pod kątem enkapsulacji odpowiedniego enzymu do poziomu precyzji, który nie jest osiągalny dla innych materiałów porowatych, takich jak zeolity, czy mezoporowate krzemionki. Właściwości te wyraźnie wyróżniają sieci metalo-organiczne na tle innych związków.Celem pracy było zsyntetyzowanie biokompozytów metodą immobilizacji wiązania powierzchniowego, w których wybrane sieci metalo-organiczne zastosowano jako materiały nośnikowe, natomiast fazę aktywną stanowił w nich enzym AcmB-His. W związku z dużym powinowactwem AcmB-His do jonów Ni2+ i występowaniem w jego strukturze 6 metek histydynowych z grupami funkcyjnymi -NH2, badania przeprowadzono z udziałem struktur Ni-MOF-74 oraz UiO-66-NH2. Następnie po opracowaniu procedury immobilizacji, wyznaczono ilość związanego białka na powierzchni nośników metodą Bradforda i scharakteryzowano powstałe biokompozyty z wykorzystaniem rentgenowskiej dyfraktometrii proszkowej (PXRD), spektroskopii w podczerwieni (IR) i obrazowania SEM. Na samym końcu przeprowadzono testy aktywności biokompozytów w specyficznej dla AcmB-His reakcji Δ1-dehydrogenacji jednego ze związków z grupy 3-ketosteroidów, androst-4-en-3,17-dionu (AD) do androst-1,4-dien-3,17-dionu (ADD) w celu określenia ich aktywności katalitycznych i stabilności operacyjnych. Postęp reakcji katalitycznych obserwowano z wykorzystaniem techniki wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC).pl
dc.affiliationWydział Chemiipl
dc.areaobszar nauk ścisłychpl
dc.contributor.advisorMatoga, Dariusz - 130394 pl
dc.contributor.authorWojtala, Paulinapl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WC3pl
dc.contributor.reviewerKyzioł, Agnieszka - 147927 pl
dc.contributor.reviewerMatoga, Dariusz - 130394 pl
dc.date.accessioned2023-07-17T21:35:42Z
dc.date.available2023-07-17T21:35:42Z
dc.date.submitted2023-07-17pl
dc.fieldofstudychemiapl
dc.identifier.apddiploma-163112-244627pl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/316658
dc.languagepolpl
dc.source.integratorfalse
dc.subject.enMetal-organic frameworks; Enzymes; Immobilization; Δ1-dehydrogenation; Catalytic activitypl
dc.subject.plSieci metalo-organiczne; Enzymy; Immobilizacja; Δ1-dehydrogenacja; Aktywność katalitycznapl
dc.titleImmobilizacja dehydrogenaz ketosteroidowych z metką histydynową w sieciach metalo- organicznychpl
dc.title.alternativeImmobilization of ketosteroid dehydrogenases with histidine tag in metal-organic frameworkspl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
Enzyme immobilization describes the potential process of physically or chemically binding enzymes to a solid substrate. This extremely effective procedure is required for important enzyme applications in medicine, environmental protection and industry. Common supports used for enzyme immobilization include silica, inorganic oxides, biopolymers, and nanoparticles. More and more information is appearing in the literature about the use of metal-organic frameworks for the enzyme binding process. Many traditional strategies that have been used to stabilize enzymes are compatible with the chemistry of MOF-type materials. In addition, the pore dimensions and chemical functionality of MOFs can be optimized to encapsulate the appropriate enzyme to a level of precision that is not achievable with other porous materials, such as zeolites or mesoporous silicas. These properties clearly distinguish metal-organic frameworks to other compounds.The aim of this study was to synthesize biocomposites by surface bond immobilization, in which selected metal-organic frameworks were used as support materials, while the active phase in them was the AcmB-His enzyme. In a view of AcmB-His's high affinity for Ni2+ ions and the presence of 6 histidine tags with -NH2 functional groups in its structure, the study was carried out with Ni-MOF-74 and UiO-66-NH2 structures. Then, after developing the immobilization procedure, the amount of attached protein on the surface of the supports was determined using the Bradford method and the resulting biocomposites were characterized using Powder X-ray Diffractometry (PXRD), Infrared Spectroscopy (IR) and SEM imaging. At the very end, the activity of the biocomposites, in the AcmB-His-specific Δ1-dehydrogenation reaction of one of the compounds of the 3-ketosteroid group, androst-4-ene-3,17-dione (AD) to androst-1,4-dien-3,17-dione (ADD), was tested to determine their catalytic activities and operational stability. The progress of catalytic reactions was observed by using High Performance Liquid Chromatography (HPLC) technique.
dc.abstract.plpl
Immobilizacja enzymów opisuje potencjalny proces fizycznego lub chemicznego wiązania enzymów na stałym podłożu. Ta wyjątkowo skuteczna procedura wymagana jest do ważnych zastosowań enzymów w medycynie, ochronie środowiska i przemyśle. Powszechnie do immobilizacji enzymów wykorzystywane są takie nośniki jak: krzemionka, tlenki nieorganiczne, biopolimery, nanocząstki. Coraz więcej pojawia się w literaturze informacji na temat wykorzystaniu sieci metalo-organicznych do procesu wiązania enzymów. Wiele tradycyjnych strategii, które zostały zastosowane do stabilizacji enzymów, są kompatybilne z chemią materiałów typu MOF. Dodatkowo wymiary porów i funkcjonalność chemiczna MOF-ów może zostać zoptymalizowana pod kątem enkapsulacji odpowiedniego enzymu do poziomu precyzji, który nie jest osiągalny dla innych materiałów porowatych, takich jak zeolity, czy mezoporowate krzemionki. Właściwości te wyraźnie wyróżniają sieci metalo-organiczne na tle innych związków.Celem pracy było zsyntetyzowanie biokompozytów metodą immobilizacji wiązania powierzchniowego, w których wybrane sieci metalo-organiczne zastosowano jako materiały nośnikowe, natomiast fazę aktywną stanowił w nich enzym AcmB-His. W związku z dużym powinowactwem AcmB-His do jonów Ni2+ i występowaniem w jego strukturze 6 metek histydynowych z grupami funkcyjnymi -NH2, badania przeprowadzono z udziałem struktur Ni-MOF-74 oraz UiO-66-NH2. Następnie po opracowaniu procedury immobilizacji, wyznaczono ilość związanego białka na powierzchni nośników metodą Bradforda i scharakteryzowano powstałe biokompozyty z wykorzystaniem rentgenowskiej dyfraktometrii proszkowej (PXRD), spektroskopii w podczerwieni (IR) i obrazowania SEM. Na samym końcu przeprowadzono testy aktywności biokompozytów w specyficznej dla AcmB-His reakcji Δ1-dehydrogenacji jednego ze związków z grupy 3-ketosteroidów, androst-4-en-3,17-dionu (AD) do androst-1,4-dien-3,17-dionu (ADD) w celu określenia ich aktywności katalitycznych i stabilności operacyjnych. Postęp reakcji katalitycznych obserwowano z wykorzystaniem techniki wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC).
dc.affiliationpl
Wydział Chemii
dc.areapl
obszar nauk ścisłych
dc.contributor.advisorpl
Matoga, Dariusz - 130394
dc.contributor.authorpl
Wojtala, Paulina
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WC3
dc.contributor.reviewerpl
Kyzioł, Agnieszka - 147927
dc.contributor.reviewerpl
Matoga, Dariusz - 130394
dc.date.accessioned
2023-07-17T21:35:42Z
dc.date.available
2023-07-17T21:35:42Z
dc.date.submittedpl
2023-07-17
dc.fieldofstudypl
chemia
dc.identifier.apdpl
diploma-163112-244627
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/316658
dc.languagepl
pol
dc.source.integrator
false
dc.subject.enpl
Metal-organic frameworks; Enzymes; Immobilization; Δ1-dehydrogenation; Catalytic activity
dc.subject.plpl
Sieci metalo-organiczne; Enzymy; Immobilizacja; Δ1-dehydrogenacja; Aktywność katalityczna
dc.titlepl
Immobilizacja dehydrogenaz ketosteroidowych z metką histydynową w sieciach metalo- organicznych
dc.title.alternativepl
Immobilization of ketosteroid dehydrogenases with histidine tag in metal-organic frameworks
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
17
Views per month
Views per city
Krakow
4
Wroclaw
2
Brzezia Łąka
1
Dąbrowa Górnicza
1
Gdansk
1
Hong Kong
1
Kutno
1
Lodz
1
Singapore
1
Szczecin
1

No access

No Thumbnail Available
Collections