title: | Wykrywanie genów zaangażowanych w proces tworzenia biofilmu u wielolekoopornych szczepów klinicznych z rodzaju Staphylococcus. |
alternative title: |
Detection of genes involved in biofilm formation in multi-drug resistant clinical strains of the genus Staphylococcus. |
author: | Gawron Anna |
reviewer: | Karczewska Elżbieta ![]() |
advisor: | Karczewska Elżbieta ![]() |
date of submittion : | 2020-07-27 |
language: | Polish |
abstract in Polish: | Biofilm jest strukturą bakteryjną składającą się z wielu komórek, otoczoną macierzą zewnątrzkomórkową i przytwierdzoną do podłoża, którym mogą być tkanki człowieka lub wprowadzane do jego organizmu biomateriały. W procesie tworzenia biofilmu bierze udział wiele różnych białek znajdujących się na powierzchni komórki, polisacharydów i innych cząsteczek. Bakterie wchodzące w skład tej wielowarstwowej struktury cechują się większą opornością na stosowane antybiotyki w porównaniu do drobnoustrojów żyjących w formie planktonicznej. Wynika to z szeregu przystosowań w komórkach znajdujących się w biofilmach, między innymi ze zmian w ekspresji genów i zmniejszeniu metabolizmu.Celem niniejszej pracy magisterskiej było wykrywanie częstotliwości genów związanych z produkcją biofilmu (icaA - gen adhezji międzykomórkowej, ang. intercellular adhesion gene) u wielolekoopornych szczepów Staphylococcus epidermidis. Odpowiada on za syntezę polisacharydowej adhezyny międzykomórkowej PIA i jest uważany za główny czynnik biorący udział w tworzeniu biofilmu.W badaniu RT-PCR wykazano obecność genu icaA dla 24 (51,1%) wśród 47 badanych szczepów. Wśród badanych izolatów 36 (76,6%) szczepów było producentami biofilmu pomimo niepotwierdzenia u 18 (50%) z nich obecności genu icaA. Może to świadczyć o występowaniu innych czynników zaangażowanych w produkcję biofilmu niezależnych od genu icaA.Wyniki przeprowadzonych badań potwierdzają, że powstawanie biofilmu jest częstym zjawiskiem wśród klinicznych szczepów Staphylococcus. Efektem zakażeń szpitalnych są częste infekcje związane z wprowadzaniem ciał obcych do ustroju pacjenta i tworzeniem tej wielokomórkowej struktury.Badania wykazały przydatność i zalety zastosowanej metody RT-PCR w diagnostyce – służącej do wykrywania markerów genetycznych odpowiedzialnych za produkcję biofilmu gronkowcowego. Potwierdzenie obecności biofilmu i identyfikacja szczepu produkującego biofilm jest ważną i istotną informacją w podejmowaniu decyzji dotyczącej wyboru terapii zakażenia.Aktualnie wiadomo, że za produkcję biofilmu odpowiedzialne są także inne geny poza icaA takie jak clfA, clfB, fnbA, fnbB, czy cna. |
abstract in English: | A biofilm is a bacterial structure consisting of many cells, surrounded by an extracellular matrix and attached to the base, which may be human tissues or biomaterials introduced into its body. Many different proteins on the cell surface, polysaccharides and other molecules are involved in the biofilm formation process. Bacteria which belong to this multilayer structure are more resistant to the antibiotics compared to microorganisms living in a planktonic form. This is due to a number of adaptations in cells found in biofilms, including changes in gene expression and reduced metabolism.The purpose of this thesis was to detect the frequency of genes associated with biofilm production (icaA - intercellular adhesion gene A) in multi-drug resistant strains of Staphylococcus epidermidis. Ica is responsible for the synthesis of the PIA polysaccharide intercellular adhesin (PIA) and is considered to be the main factor involved in biofilm formation.RT-PCR showed the presence of the icaA gene for 24 (51,1%) of the 47 strains tested.Among the tested isolates 36 (76,6%) strains were biofilm producers, despite the fact that 18 (50%) of them did not confirm the presence of the icaA gene. It may indicate the presence of other factors involved in biofilm production independent of the icaA gene.The results of the conducted research confirm that biofilm formation is an often phenomenon among clinical Staphylococcus strains. Hospital infections result are frequent infections associated with the introduction of foreign bodies into the patient's body and the formation of this multicellular structure.Research has shown the usefulness and benefits of the RT-PCR method used in diagnostics - used to detect genetic markers responsible for the production of staph biofilm.Confirming the presence of a biofilm and identifying the biofilm producing strain is important information in making decisions regarding the choice of infection therapy.Currently known that other genes besides icaA, such as clfA, clfB, fnbA, fnbB, and cna are also responsible for biofilm production. |
keywords in Polish: | biofilm, geny, polisacharydowa adhezyna międzykomórkowa, RT-PCR, Staphylococcus epidermidis |
keywords in English: | biofilm, genes, polysaccharide intercellular adhesin, RT-PCR, Staphylococcus epidermidis |
affiliation: | Wydział Farmaceutyczny |
type: | master work |
Files | Size | Format | View |
---|---|---|---|
There are no files associated with this item. |