Simple view
Full metadata view
Authors
Statistics
Distributed electric polarizability of a peptide bond.
Dipeptydy; Wiązanie peptydowe; Gęstość elektronowa; Polaryzowalność;
Dipeptides; Peptide bond; Electron density; Polarizability;
Celem niniejszej pracy było zbadanie właściwości elektrycznych a konkretnie polaryzowalności wiązania peptydowego wszystkich dipeptydów zbudowanych z aminokwasów biogennych. Zbadano związek między łańcuchem bocznym a wartością polaryzowalności wiązania peptydowego. Podjęto również próbę skorelowania punktu izoelektrycznego z wartościami polaryzowalności wiązania peptydowego. W celu uzyskania pełnego obrazu zachowania badanych dipeptydów w odniesieniu do środowiska chemicznego przeprowadzono obliczenia dla czterech stanów protonacji: formy obojnaczej, kationowej, anionowej i neutralnej. Analiza uzyskanych wyników pozwoliła na określenie trendów zachodzących między polaryzowalnościami grupowymi poszczególnych dipeptydów, w szczególności wiązań peptydowych, i wówczas możliwe było zaobserwowanie interesujących korelacji. Określone średnie wartości polaryzowalności dobrze reprezentują całą grupę związków. Sugeruje to, że można je wykorzystać jako istotne dane w niedawno opracowanej bazie danych polaryzowalności grup funkcyjnych.
Work was focused on the analysis of electric properties of all dipeptides built from biogenic amino acids that have been selected as models. The relationship between the side chain and the value of group polarizability of a peptide bond was investigated. An attempt was also made to correlate the isoelectric point with the group polarizability values of the peptide bond. In order to obtain a full picture of the behavior of the studied dipeptides with respect to the chemical environment, calculations were carried out on four protonation states: zwitterion, cation, anion and neutral form. The analysis of the obtained results made it possible to determine trends that occur between group polarizabilities of individual dipeptides, in particular of peptide bonds and emerged interesting relationships. Determined mean values of polarizabilities represent well the whole group of compounds. This suggests that they can be used as input values in recently developed group polarizability database.
dc.abstract.en | Work was focused on the analysis of electric properties of all dipeptides built from biogenic amino acids that have been selected as models. The relationship between the side chain and the value of group polarizability of a peptide bond was investigated. An attempt was also made to correlate the isoelectric point with the group polarizability values of the peptide bond. In order to obtain a full picture of the behavior of the studied dipeptides with respect to the chemical environment, calculations were carried out on four protonation states: zwitterion, cation, anion and neutral form. The analysis of the obtained results made it possible to determine trends that occur between group polarizabilities of individual dipeptides, in particular of peptide bonds and emerged interesting relationships. Determined mean values of polarizabilities represent well the whole group of compounds. This suggests that they can be used as input values in recently developed group polarizability database. | pl |
dc.abstract.pl | Celem niniejszej pracy było zbadanie właściwości elektrycznych a konkretnie polaryzowalności wiązania peptydowego wszystkich dipeptydów zbudowanych z aminokwasów biogennych. Zbadano związek między łańcuchem bocznym a wartością polaryzowalności wiązania peptydowego. Podjęto również próbę skorelowania punktu izoelektrycznego z wartościami polaryzowalności wiązania peptydowego. W celu uzyskania pełnego obrazu zachowania badanych dipeptydów w odniesieniu do środowiska chemicznego przeprowadzono obliczenia dla czterech stanów protonacji: formy obojnaczej, kationowej, anionowej i neutralnej. Analiza uzyskanych wyników pozwoliła na określenie trendów zachodzących między polaryzowalnościami grupowymi poszczególnych dipeptydów, w szczególności wiązań peptydowych, i wówczas możliwe było zaobserwowanie interesujących korelacji. Określone średnie wartości polaryzowalności dobrze reprezentują całą grupę związków. Sugeruje to, że można je wykorzystać jako istotne dane w niedawno opracowanej bazie danych polaryzowalności grup funkcyjnych. | pl |
dc.affiliation | Wydział Chemii | pl |
dc.area | obszar nauk ścisłych | pl |
dc.contributor.advisor | Krawczuk, Anna - 147389 | pl |
dc.contributor.author | Jabłuszewska, Angelika | pl |
dc.contributor.departmentbycode | UJK/WC3 | pl |
dc.contributor.reviewer | Krawczuk, Anna - 147389 | pl |
dc.contributor.reviewer | Mitoraj, Mariusz - 160142 | pl |
dc.date.accessioned | 2020-08-05T13:59:30Z | |
dc.date.available | 2020-08-05T13:59:30Z | |
dc.date.submitted | 2020-07-30 | pl |
dc.fieldofstudy | chemia medyczna | pl |
dc.identifier.apd | diploma-138308-218986 | pl |
dc.identifier.project | APD / O | pl |
dc.identifier.uri | https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/243502 | |
dc.language | eng | pl |
dc.subject.en | Dipeptides; Peptide bond; Electron density; Polarizability; | pl |
dc.subject.pl | Dipeptydy; Wiązanie peptydowe; Gęstość elektronowa; Polaryzowalność; | pl |
dc.title | Distributed electric polarizability of a peptide bond. | pl |
dc.title.alternative | Dystrybuowane polaryzowalności wiązania peptydowego. | pl |
dc.type | master | pl |
dspace.entity.type | Publication |