W dniach od 2 kwietnia do 5 kwietnia 2024 r. prowadzone będą prace związane z wdrożeniem nowej wersji systemu Repozytorium UJ. Nie będzie możliwe wprowadzanie nowych informacji do repozytorium. Za utrudnienia przepraszamy.
Rozmaitość sekwencji mtDNA kumaka górskiego, Bombina variegata, w Rumunii
wariant tytułu:
MtDNA sequence diversity of the yellow-bellied toad, Bombina variegata, in Romania
autor:
Mojżesz Miriam
recenzent:
Szymura Jacek M. , Falniowski Andrzej
promotor:
Szymura Jacek M.
data obrony
:
2016-07-12
język:
polski
abstrakt w j. polskim:
Kumak górski (Bombina variegata) jest gatunkiem o złożonej historii ewolucyjnej. Oscylacje klimatyczne związane ze zlodowaceniami plejstoceńskimi znacząco wpłynęły na współczesny obraz zmienności genetycznej B.variegata.Istniejące w przeszłości refugia glacjalne umożliwiły przetrwanie tego gatunku oraz nagromadzenie się licznych polimorfizmów mtDNA. Postglacjalna ekspansja na tereny północne, której towarzyszy dryf genetyczny jest przyczyną zmniejszania różnorodności genetycznej populacji północnych. W pracy analizowano 92 nowe próby B.variegata pochodzące z 21 stanowisk Rumunii oraz 331 sekwencji referencyjnych gatunku ze 152 stanowisk reprezentujących cały klad karpacki. W pracy izolowano mtDNA, następnie amplifikowano metodą PCR gen kodujący cytochrom b. Skompletowane sekwencje zostały poddane analizom populacyjnym.Nowe badania różnorodności mtDNA nie zmieniły znacząco obrazu zmienności B.variegata. Analizy potwierdziły niewielką rozmaitość genetyczną kladu karpackiego. Zidentyfikowane osobniki kladu bałkańsko-zachodniego na terenie Rumunii potwierdziły możliwość kontaktu tego kladu z kladem karpackim. Wyższa zmienność genetyczna w południowych Karpatach jest zgodna z wcześniejszymi badaniami, identyfikującymi na tych obszarach hipotetyczne refugia glacjalne. Efekt założyciela związany z postglacjalna ekspansją najprawdopodobniej wpłyną na zmniejszenie zmienności genetycznej grup północnych. Analizy wyodrębniły nowy klad karpacki B.variegata (C4-3), zlokalizowany na południowych stokach południowo-zachodnich Karpat. Praca rozszerzyła zasięg kladu C4-1 na południowo-zachodnie Karpaty. W porównaniu do wcześniejszych prac nowe analizy wskazują na większą liczbękontaktów wtórnych kladów karpackich.
abstrakt w j. angielskim:
The Yellow-bellied toad (B.variegata) is a species with a complex evolutionary history. Climatic oscillations during the Pleistocene glaciations significantly influenced the genetic structure of B.variegata. Glacial refugia in Europe allowed the survival of this species and the accumulation of numerous polymorphisms mtDNA. Post-glacialexpansion in the northern areas and genetic drift is the cause of reducing the genetic diversity. This study analyzed 92 new sequences of B.variegata from 21 localities in Romania and 331in addition to reference sequences from 131 localities representing the entire range of the Carpathian clade. Mitochondrial cytochrome b (cyt b) sequences were obtained by amplifying by PCR method. The complete sequences were subjectedto population analyses. New mtDNA study did not change significantly the image of genetic variation in B.variegata. The analysis confirmed low genetic diversity of the Carpathian clade. Finding of specimens with mtDNA of the Balkano-Western clade (BW) in Romania points to a secondary contact between this clade (BW) and the Carpathian clade. Higher genetic variability in the Southern Carpathian Mountains is consistent with previous studies, identifying these areas as hypothetical glacial refugia. Reduction of genetic variability in northern populations is likely due to the founder effect associated with post-glacial expansion. Extended sampling identified a new Carpathian clade in B. variegata (C4-3), localized on the southern slopes of the Southwestern Carpathians.