Simple view
Full metadata view
Authors
Statistics
Przygotowywanie biblioteki cDNA zawierającej sekwencje genów oksydoreduktaz ferredoksyna- NADP+ wyizolowanych z wybranych gatunków z rodzaju Arabidopsis, pochodzących z środowisk wzbogaconych w metale ciężkie oraz z terenów niezanieczyszczonych- opracowanie metody
oksydoreduktaza ferredoksyna-NADP+ (FNR), Arabidopsis arenosa, Arabidopsis halleri, cDNA, metale ciężkie
ferredoxin:NADP+ oxidoreductase (FNR), Arabidopsis arenosa, Arabidopsis halleri, cDNA, heavy metals
Enzym chloroplastowy oksydoreduktaza ferredoksyna- NADP+ występuje w Arabidopsis thaliana w dwóch izoformach- FNR1 i FNR2- kodowanych przez osobne geny. Nie ma danych literaturowych na temat analogów z dziko rosnących gatunków pokrewnych. Celem eksperymentów było uzyskanie stabilnego cDNA dla FNR1 i FNR2 z Arabidopsis halleri i Arabidopsis arenosa- gatunków modelowych do badania roślinnych mechanizmów odporności na metale ciężkie. Następnie uzyskane cDNA amplifikowano za pomocą starterów zaprojektowanych dla sekwencji z A. thaliana, ekotyp Columbia. Dodatkowo przeprowadzono izolację i rozdział elektroforetyczny w warunkach natywnych białek z badanych próbek roślinnych. Wykazano, że stabilność cDNA była pozytywnie skorelowana z czystością RNA matrycowego. Wyniki sugerują, że zaprojektowane startery mogą być używane jako markery molekularne do odróżniania A.arenosa od A. halleri oraz A.arenosa i mieszańców pomiędzy tymi gatunkami. Wskazują ponadto na podobieństwo sekwencji cDNA w obrębie miejsc wiązania starterów oraz rozbieżność wewnątrz łańcucha cDNA pomiędzy A. halleri i A. thaliana, Columbia.
The chloroplast enzyme oxidoreductase ferredoxin- NADP+ exists in Arabidopsis thaliana as two izoforms, FNR1 and FNR2, encoded by separate genes. There is no data about analogues from related wild species. The aim of my experiments was to obtain stable cDNA for FNR1 and FNR2 from Arabidopsis halleri and Arabidopsis arenosa, the representative species for examining the mechanisms of plant resistance to heavy metals. Subsequently, obtained cDNA were amplified with starters designed for the sequence from A. thaliana, Columbia ecotype. Additionally an isolation and an electrophoresis in native conditions of proteins from tested plant samples were conducted. The result have shown that the cDNA stability was positively correlated with the purity of RNA matrix. The findings suggest that designed starters can be used as molecular markers for distinguishing A.arenosa and A. halleri or A.arenosa and hybrids among these species. The results also indicates a similarity between A. thaliana and A. halleri in cDNA sequences in complementary regions to primers, and divergence of the sequence inside the chain.
dc.abstract.en | The chloroplast enzyme oxidoreductase ferredoxin- NADP+ exists in Arabidopsis thaliana as two izoforms, FNR1 and FNR2, encoded by separate genes. There is no data about analogues from related wild species. The aim of my experiments was to obtain stable cDNA for FNR1 and FNR2 from Arabidopsis halleri and Arabidopsis arenosa, the representative species for examining the mechanisms of plant resistance to heavy metals. Subsequently, obtained cDNA were amplified with starters designed for the sequence from A. thaliana, Columbia ecotype. Additionally an isolation and an electrophoresis in native conditions of proteins from tested plant samples were conducted. The result have shown that the cDNA stability was positively correlated with the purity of RNA matrix. The findings suggest that designed starters can be used as molecular markers for distinguishing A.arenosa and A. halleri or A.arenosa and hybrids among these species. The results also indicates a similarity between A. thaliana and A. halleri in cDNA sequences in complementary regions to primers, and divergence of the sequence inside the chain. | pl |
dc.abstract.pl | Enzym chloroplastowy oksydoreduktaza ferredoksyna- NADP+ występuje w Arabidopsis thaliana w dwóch izoformach- FNR1 i FNR2- kodowanych przez osobne geny. Nie ma danych literaturowych na temat analogów z dziko rosnących gatunków pokrewnych. Celem eksperymentów było uzyskanie stabilnego cDNA dla FNR1 i FNR2 z Arabidopsis halleri i Arabidopsis arenosa- gatunków modelowych do badania roślinnych mechanizmów odporności na metale ciężkie. Następnie uzyskane cDNA amplifikowano za pomocą starterów zaprojektowanych dla sekwencji z A. thaliana, ekotyp Columbia. Dodatkowo przeprowadzono izolację i rozdział elektroforetyczny w warunkach natywnych białek z badanych próbek roślinnych. Wykazano, że stabilność cDNA była pozytywnie skorelowana z czystością RNA matrycowego. Wyniki sugerują, że zaprojektowane startery mogą być używane jako markery molekularne do odróżniania A.arenosa od A. halleri oraz A.arenosa i mieszańców pomiędzy tymi gatunkami. Wskazują ponadto na podobieństwo sekwencji cDNA w obrębie miejsc wiązania starterów oraz rozbieżność wewnątrz łańcucha cDNA pomiędzy A. halleri i A. thaliana, Columbia. | pl |
dc.affiliation | Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii | pl |
dc.area | obszar nauk przyrodniczych | pl |
dc.contributor.advisor | Bojko, Monika - 127393 | pl |
dc.contributor.author | Tuleja, Urszula | pl |
dc.contributor.departmentbycode | UJK/WBBB | pl |
dc.contributor.reviewer | Malec, Przemysław - 130259 | pl |
dc.contributor.reviewer | Bojko, Monika - 127393 | pl |
dc.date.accessioned | 2020-07-26T18:18:32Z | |
dc.date.available | 2020-07-26T18:18:32Z | |
dc.date.submitted | 2015-10-15 | pl |
dc.fieldofstudy | biotechnologia | pl |
dc.identifier.apd | diploma-101204-126905 | pl |
dc.identifier.project | APD / O | pl |
dc.identifier.uri | https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/208225 | |
dc.language | pol | pl |
dc.subject.en | ferredoxin:NADP+ oxidoreductase (FNR), Arabidopsis arenosa, Arabidopsis halleri, cDNA, heavy metals | pl |
dc.subject.pl | oksydoreduktaza ferredoksyna-NADP+ (FNR), Arabidopsis arenosa, Arabidopsis halleri, cDNA, metale ciężkie | pl |
dc.title | Przygotowywanie biblioteki cDNA zawierającej sekwencje genów oksydoreduktaz ferredoksyna- NADP+ wyizolowanych z wybranych gatunków z rodzaju Arabidopsis, pochodzących z środowisk wzbogaconych w metale ciężkie oraz z terenów niezanieczyszczonych- opracowanie metody | pl |
dc.title.alternative | Preparation of the cDNA library containing sequences of oxidoreductases ferredoxin- NADP+ isolated from chosen species of Arabidopsis coming from heavy metals-contaminated and untainted areas- preliminary studies | pl |
dc.type | master | pl |
dspace.entity.type | Publication |