Modele dopasowywania par sekwencji genetycznych i systemy punktacji

Bibliographic description

title:	Modele dopasowywania par sekwencji genetycznych i systemy punktacji
alternative title:	Pairwise sequence alignment models and scoring systems
author:	Kacwin Daria
reviewer:	Zaremba-Śmietański Jacek, Mazur Marcin
advisor:	Zaremba-Śmietański Jacek
date of submittion :	2014-09-23
language:	Polish
abstract in Polish:	W pracy przedstawiono algorytm Needlemana – Wunscha i Smitha – Watermana w postaci liniowej i aﬁnicznej do znajdowania optymalnego dopasowania globalnego i lokalnego dwóch sekwencji oraz omówiono najpopularniejsze macierze substytucji PAM i BLOSUM wraz ze sposobami dobierania punktacji do analizowanych sekwencji i określania wiarygodności otrzymanych wyników za pomocą narzędzi statystycznych.
abstract in English:	Presenting Needleman – Wunsch and Smith – Waterman algorithms with linear and affine gap penalty models for searching optimal global and local alignment of two sequences. Describing the most popular amino acid substitution matrices PAM and BLOSUM, the choice of gap penalties and scoring parameters for examined sequences. Testing significance of results by using statistical methods.
keywords in Polish:	dopasowywanie sekwencji, macierz substytucji
keywords in English:	sequence alignment, substitution matrix
affiliation:	Wydział Matematyki i Informatyki
type:	master work

Files	Size	Format	View
There are no files associated with this item.