Rozkłady hydrofobowości w białkach

master
dc.abstract.enThe goal of my Master’s thesis is to create web application that loads XML file with protein structure downloaded from Protein Data Bank (PDB) and will carry out a number of calculations needed to hydrophobic distribution in a protein molecule. The calculations that the application performs are translations and rotations of the protein molecule, 3D Gaussian function for amino acids, hydrophobic distribution of amino acids, Kullback-Leibler divergence (relative entropy) and normalization of results. The application will be placed on the faculty server and the results will be available for download in XLS format.pl
dc.abstract.plCelem mojej pracy jest stworzenie aplikacji webowej, która po wczytaniu pliku XML ze strukturą białka pobranego z bazy białek PDB (Protein Data Bank) przeprowadzi szereg obliczeń potrzebnych do rozkładu hydrofobowości białka. Obliczenia które aplikacja wykonuje to translacje oraz rotacje molekuły białka, wyznaczenie funkcji 3D Gaussa dla aminokwasów, rozkłady hydrofobowości aminokwasów, dywergencja Kullbacka-Leiblera (entropia względna) oraz normalizacja wyników.Aplikacja ma zostać umieszczona na wydziałowym serwerze, a wyniki będą dostępne do pobrania w formacie XLS.pl
dc.affiliationWydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanejpl
dc.areaobszar nauk ścisłychpl
dc.contributor.advisorRoterman-Konieczna, Irenapl
dc.contributor.authorHałat, Robertpl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WFAISpl
dc.contributor.reviewerRoterman-Konieczna, Irenapl
dc.contributor.reviewerRajfur, Zenonpl
dc.date.accessioned2020-07-28T01:20:55Z
dc.date.available2020-07-28T01:20:55Z
dc.date.submitted2019-09-26pl
dc.fieldofstudyinformatyka stosowanapl
dc.identifier.apddiploma-134131-176247pl
dc.identifier.projectAPD / Opl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/236372
dc.languagepolpl
dc.subject.enhydrophobic distribution, proteins, 3d Gaussian function, relative entrophypl
dc.subject.plrozkłady hydrofobowości, białka, funkcja 3d Gaussa, entropia względnapl
dc.titleRozkłady hydrofobowości w białkachpl
dc.title.alternativeHydrophobic distribution in proteinspl
dc.typemasterpl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
The goal of my Master’s thesis is to create web application that loads XML file with protein structure downloaded from Protein Data Bank (PDB) and will carry out a number of calculations needed to hydrophobic distribution in a protein molecule. The calculations that the application performs are translations and rotations of the protein molecule, 3D Gaussian function for amino acids, hydrophobic distribution of amino acids, Kullback-Leibler divergence (relative entropy) and normalization of results. The application will be placed on the faculty server and the results will be available for download in XLS format.
dc.abstract.plpl
Celem mojej pracy jest stworzenie aplikacji webowej, która po wczytaniu pliku XML ze strukturą białka pobranego z bazy białek PDB (Protein Data Bank) przeprowadzi szereg obliczeń potrzebnych do rozkładu hydrofobowości białka. Obliczenia które aplikacja wykonuje to translacje oraz rotacje molekuły białka, wyznaczenie funkcji 3D Gaussa dla aminokwasów, rozkłady hydrofobowości aminokwasów, dywergencja Kullbacka-Leiblera (entropia względna) oraz normalizacja wyników.Aplikacja ma zostać umieszczona na wydziałowym serwerze, a wyniki będą dostępne do pobrania w formacie XLS.
dc.affiliationpl
Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej
dc.areapl
obszar nauk ścisłych
dc.contributor.advisorpl
Roterman-Konieczna, Irena
dc.contributor.authorpl
Hałat, Robert
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WFAIS
dc.contributor.reviewerpl
Roterman-Konieczna, Irena
dc.contributor.reviewerpl
Rajfur, Zenon
dc.date.accessioned
2020-07-28T01:20:55Z
dc.date.available
2020-07-28T01:20:55Z
dc.date.submittedpl
2019-09-26
dc.fieldofstudypl
informatyka stosowana
dc.identifier.apdpl
diploma-134131-176247
dc.identifier.projectpl
APD / O
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/236372
dc.languagepl
pol
dc.subject.enpl
hydrophobic distribution, proteins, 3d Gaussian function, relative entrophy
dc.subject.plpl
rozkłady hydrofobowości, białka, funkcja 3d Gaussa, entropia względna
dc.titlepl
Rozkłady hydrofobowości w białkach
dc.title.alternativepl
Hydrophobic distribution in proteins
dc.typepl
master
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
4
Views per month
Views per city
Wroclaw
2
Dublin
1
Stein
1

No access

No Thumbnail Available