Produkcja rekombinowanych ligaz DNA T4 oraz p50-T4. Porównanie aktywności enzymów z komercyjnie dostępnymi odpowiednikami

licenciate
dc.abstract.enJoining of DNA fragments catalyzed by DNA ligase has a wide range of applications in molecular biology and related fields. Despite frequent use, the ligation reaction often fails in practice. This thesis describes the process of production of T4 DNA ligase and T4 DNA ligase with the p50 fusion protein at the N-terminus. Particular attention was paid to the analysis of the enzymatic activity of the obtained proteins and the comparison of this activity with the commercially available T4 DNA ligase sold by the Thermo Fisher Scientific company. The results of the analysis show that, under appropriate conditions, the produced enzymes may have up to 30% higher activity compared to the activity of the commercial ligase. The p50-T4 DNA ligase also showed higher specificity in the case of the ligation of the blunt-ended fragments, which demonstrates its advantage over the T4 DNA ligase.pl
dc.abstract.plŁączenie fragmentów DNA katalizowane przez ligazę DNA ma szerokie zastosowanie w biologii molekularnej i pokrewnych dziedzinach. Pomimo częstego użytku, w praktyce reakcja ligacji często kończy się niepowodzeniem. W niniejszej pracy opisano proces produkcji ligazy DNA T4 oraz ligazy DNA z białkiem fuzyjnym p50 na N-końcu. Szczególnie skupiono się na analizie aktywności enzymatycznej otrzymanych białek oraz na porównaniu tej aktywności z komercyjnie dostępną ligazą DNA T4 sprzedawaną przez firmę Thermo Fisher Scientific. Wyniki analizy wskazują, że w odpowiednich warunkach wyprodukowane enzymy mogą mieć nawet o 30% wyższą aktywność w porównaniu do aktywności komercyjnej ligazy. Ligaza DNA p50-T4 również wykazała wyższą specyficzność w przypadku ligacji fragmentów o tępych końcach, co pozwala stwierdzić, że ma ona przewagę nad ligazą DNA T4.pl
dc.affiliationWydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologiipl
dc.areaobszar nauk przyrodniczychpl
dc.contributor.advisorBłasiak, Ewapl
dc.contributor.authorVoloshchuk, Nataliiapl
dc.contributor.departmentbycodeUJK/WBBBpl
dc.contributor.reviewerBłasiak, Ewapl
dc.contributor.reviewerPłonka, Przemysław - 131459 pl
dc.date.accessioned2022-07-07T22:13:55Z
dc.date.available2022-07-07T22:13:55Z
dc.date.submitted2022-07-06pl
dc.fieldofstudybiotechnologiapl
dc.identifier.apddiploma-160309-279656pl
dc.identifier.urihttps://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/295432
dc.languagepolpl
dc.subject.enT4 DNA ligase, recombinant protein, densitometry, DNAsymepl
dc.subject.plLigaza DNA T4, białko rekombinowane, densytometria, DNAzympl
dc.titleProdukcja rekombinowanych ligaz DNA T4 oraz p50-T4. Porównanie aktywności enzymów z komercyjnie dostępnymi odpowiednikamipl
dc.title.alternativeProduction of recombinant T4 and p50-T4 DNA ligases. Comparison of enzyme activities with commercially available counterpartspl
dc.typelicenciatepl
dspace.entity.typePublication
dc.abstract.enpl
Joining of DNA fragments catalyzed by DNA ligase has a wide range of applications in molecular biology and related fields. Despite frequent use, the ligation reaction often fails in practice. This thesis describes the process of production of T4 DNA ligase and T4 DNA ligase with the p50 fusion protein at the N-terminus. Particular attention was paid to the analysis of the enzymatic activity of the obtained proteins and the comparison of this activity with the commercially available T4 DNA ligase sold by the Thermo Fisher Scientific company. The results of the analysis show that, under appropriate conditions, the produced enzymes may have up to 30% higher activity compared to the activity of the commercial ligase. The p50-T4 DNA ligase also showed higher specificity in the case of the ligation of the blunt-ended fragments, which demonstrates its advantage over the T4 DNA ligase.
dc.abstract.plpl
Łączenie fragmentów DNA katalizowane przez ligazę DNA ma szerokie zastosowanie w biologii molekularnej i pokrewnych dziedzinach. Pomimo częstego użytku, w praktyce reakcja ligacji często kończy się niepowodzeniem. W niniejszej pracy opisano proces produkcji ligazy DNA T4 oraz ligazy DNA z białkiem fuzyjnym p50 na N-końcu. Szczególnie skupiono się na analizie aktywności enzymatycznej otrzymanych białek oraz na porównaniu tej aktywności z komercyjnie dostępną ligazą DNA T4 sprzedawaną przez firmę Thermo Fisher Scientific. Wyniki analizy wskazują, że w odpowiednich warunkach wyprodukowane enzymy mogą mieć nawet o 30% wyższą aktywność w porównaniu do aktywności komercyjnej ligazy. Ligaza DNA p50-T4 również wykazała wyższą specyficzność w przypadku ligacji fragmentów o tępych końcach, co pozwala stwierdzić, że ma ona przewagę nad ligazą DNA T4.
dc.affiliationpl
Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
dc.areapl
obszar nauk przyrodniczych
dc.contributor.advisorpl
Błasiak, Ewa
dc.contributor.authorpl
Voloshchuk, Nataliia
dc.contributor.departmentbycodepl
UJK/WBBB
dc.contributor.reviewerpl
Błasiak, Ewa
dc.contributor.reviewerpl
Płonka, Przemysław - 131459
dc.date.accessioned
2022-07-07T22:13:55Z
dc.date.available
2022-07-07T22:13:55Z
dc.date.submittedpl
2022-07-06
dc.fieldofstudypl
biotechnologia
dc.identifier.apdpl
diploma-160309-279656
dc.identifier.uri
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/295432
dc.languagepl
pol
dc.subject.enpl
T4 DNA ligase, recombinant protein, densitometry, DNAsyme
dc.subject.plpl
Ligaza DNA T4, białko rekombinowane, densytometria, DNAzym
dc.titlepl
Produkcja rekombinowanych ligaz DNA T4 oraz p50-T4. Porównanie aktywności enzymów z komercyjnie dostępnymi odpowiednikami
dc.title.alternativepl
Production of recombinant T4 and p50-T4 DNA ligases. Comparison of enzyme activities with commercially available counterparts
dc.typepl
licenciate
dspace.entity.type
Publication
Affiliations

* The migration of download and view statistics prior to the date of April 8, 2024 is in progress.

Views
1
Views per month
Views per city
Vilnius
1

No access

No Thumbnail Available