W dniach od 2 kwietnia do 5 kwietnia 2024 r. prowadzone będą prace związane z wdrożeniem nowej wersji systemu Repozytorium UJ. Nie będzie możliwe wprowadzanie nowych informacji do repozytorium. Za utrudnienia przepraszamy.
Oddziaływanie cytotoksycznych peptydów bakteryjnych z membranami lipidowymi badane metodą dynamiki molekularnej
pl
dc.title.alternative
The interaction of cytotoxic bacterial peptides with lipid membranes investigated by the molecular dynamics method
pl
dc.type
master
pl
dc.abstract.pl
Niniejsze badania rzuciły światło na to jakie oddziaływania występują pomiędzy białkiem PSMβ-2 a powierzchnią membran POPC czystych oraz wzbogaconych cholesterolem. Wykazano, że sama organizacja białka na powierzchni może być związana ze sztywnością membran oraz dostępnością do kluczowych akceptorów wiązań wodorowych membrany. Obecność białka PSMβ-2 może wpływać na oddziaływania pomiędzy lipidami POPC i cholesterolem. Wyniki wskazują, że możliwości adsorpcyjne białka mogą zależeć od obecności cholesterolu, który powoduje uporządkowanie POPC. W N-końcowej części PSMβ-2 znaleziono pętlę pośredniczącą w kontakcie białka z membraną POPC. Ustalono również, że segmentem odpowiedzialnym za kluczową dynamikę i konformację struktury jest krótka helisa w centrum sekwencji oraz jej bogate sąsiedztwo zwrotów strukturalnych.
pl
dc.abstract.en
This study shed light on the interactions between PSMβ-2 protein and the surface of pure and cholesterol-enriched POPC membranes. It has been shown that the very organization of the protein on the surface can be related to the stiffness of the membranes and the availability of key acceptors of the membrane hydrogen bonds. The presence of PSMβ-2 protein may influence the interactions between POPC lipids and cholesterol. The results indicate that the adsorption potential of the protein may depend on the presence of cholesterol, which causes the ordering of POPC. In the N-terminal part of PSMβ-2 an intermediary loop was found in contact of the protein with POPC membrane. It was also found that the segment responsible for key dynamics and structure conformation is the short helix in the center of the sequence and its rich neighborhood of structural expressions.