Simple view
Full metadata view
Authors
Statistics
Krystalizacja kurzego białka wiążącego ryboflawinę oraz jego kompleksów z ligandami
Ryboflawina, białko, krystalizacja, optymalizacja, kryształ
Riboflavin, protein, crystallization, optimization, crystal
Białko wiążące ryboflawinę (Riboflavin Binding Protein, RBP) występuje w jajach kurzych oraz jajach innych ptaków, takich jak: kaczka, przepiórka, struś czy indyk. U kur RBP występuje zarówno w białku i żółtku jaja, jak również w osoczu krwi. Naturalnym ligandem RBP jest ryboflawina (wit. B2), wiążąca się w hydrofobowej kieszeni. Aby lepiej poznać mechanizm wiązania się leków do RBP, przeprowadzono szereg prób wykrystalizowania tego białka z czterema ligandami: flufenazyną, kwinakryną, alloksazyną oraz fosforanem ryboflawiny. Białko jaja kurzego krystalizowano techniką wiszącej kropli, używając różnych stężeń białka, buforów, ligandów, a także różnego zakresu pH. Podczas przeprowadzanych badań najwięcej kryształów otrzymano używając 0,5 M buforu Tris-HCl pH=8,5 z dodatkiem 45 % (w/v) siarczanu amonu. Najlepszej jakości kryształy pojawiały się w obecności alloksazyny, w warunkach: 0,1 M bufor HEPES pH=8,5 z dodatkiem 45 % (w/v) siarczanu amonu. Dla tego liganda udało się zoptymalizować warunki tak, aby w kropli powstały duże, pojedyncze kryształy.
Riboflavin Binding Protein (RBP) can be found in chicken eggs and eggs of other birds such as ducks, quails, ostrich or turkey. In chickens, RBP is found in the yolk and white of the eggs and also in plasma. The natural ligand of RBP is riboflavin (vitamin B2), bound in a hydrophobic „pocket”. In order to understand the mechanism of drug binding by RBP a number of crystallization trials were performed to obtain RBP complexes with four ligands: fluphenazine, quinacrine, alloxazine and riboflavin phosphate. The RBP was crystallized by the hanging drop technique, with the use of different concentration of protein, buffer, ligands, as well as various pH values. The largest number of crystals was obtained by using 0,5 M buffer Tris-HCl, pH=8,5 with the addition of 45% ammonium sulphate . Crystals of the best quality were obtained in the presence of alloxazine in conditions: 0,1 M buffer HEPES pH=8,5 45% ammonium sulphate . In this case, it was possible to obtain large, single crystals in a drop.
dc.abstract.en | Riboflavin Binding Protein (RBP) can be found in chicken eggs and eggs of other birds such as ducks, quails, ostrich or turkey. In chickens, RBP is found in the yolk and white of the eggs and also in plasma. The natural ligand of RBP is riboflavin (vitamin B2), bound in a hydrophobic „pocket”. In order to understand the mechanism of drug binding by RBP a number of crystallization trials were performed to obtain RBP complexes with four ligands: fluphenazine, quinacrine, alloxazine and riboflavin phosphate. The RBP was crystallized by the hanging drop technique, with the use of different concentration of protein, buffer, ligands, as well as various pH values. The largest number of crystals was obtained by using 0,5 M buffer Tris-HCl, pH=8,5 with the addition of 45% ammonium sulphate . Crystals of the best quality were obtained in the presence of alloxazine in conditions: 0,1 M buffer HEPES pH=8,5 45% ammonium sulphate . In this case, it was possible to obtain large, single crystals in a drop. | pl |
dc.abstract.pl | Białko wiążące ryboflawinę (Riboflavin Binding Protein, RBP) występuje w jajach kurzych oraz jajach innych ptaków, takich jak: kaczka, przepiórka, struś czy indyk. U kur RBP występuje zarówno w białku i żółtku jaja, jak również w osoczu krwi. Naturalnym ligandem RBP jest ryboflawina (wit. B2), wiążąca się w hydrofobowej kieszeni. Aby lepiej poznać mechanizm wiązania się leków do RBP, przeprowadzono szereg prób wykrystalizowania tego białka z czterema ligandami: flufenazyną, kwinakryną, alloksazyną oraz fosforanem ryboflawiny. Białko jaja kurzego krystalizowano techniką wiszącej kropli, używając różnych stężeń białka, buforów, ligandów, a także różnego zakresu pH. Podczas przeprowadzanych badań najwięcej kryształów otrzymano używając 0,5 M buforu Tris-HCl pH=8,5 z dodatkiem 45 % (w/v) siarczanu amonu. Najlepszej jakości kryształy pojawiały się w obecności alloksazyny, w warunkach: 0,1 M bufor HEPES pH=8,5 z dodatkiem 45 % (w/v) siarczanu amonu. Dla tego liganda udało się zoptymalizować warunki tak, aby w kropli powstały duże, pojedyncze kryształy. | pl |
dc.affiliation | Wydział Chemii | pl |
dc.area | obszar nauk ścisłych | pl |
dc.contributor.advisor | Loch, Joanna | pl |
dc.contributor.author | Maruszak, Agata | pl |
dc.contributor.departmentbycode | UJK/WC3 | pl |
dc.contributor.reviewer | Loch, Joanna | pl |
dc.contributor.reviewer | Lewiński, Krzysztof - 129948 | pl |
dc.date.accessioned | 2020-07-26T20:12:50Z | |
dc.date.available | 2020-07-26T20:12:50Z | |
dc.date.submitted | 2016-06-30 | pl |
dc.fieldofstudy | chemia | pl |
dc.identifier.apd | diploma-103483-178798 | pl |
dc.identifier.project | APD / O | pl |
dc.identifier.uri | https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/209999 | |
dc.language | pol | pl |
dc.subject.en | Riboflavin, protein, crystallization, optimization, crystal | pl |
dc.subject.pl | Ryboflawina, białko, krystalizacja, optymalizacja, kryształ | pl |
dc.title | Krystalizacja kurzego białka wiążącego ryboflawinę oraz jego kompleksów z ligandami | pl |
dc.title.alternative | Crystallization of chicken riboflavin binding protein and its complexes with ligands | pl |
dc.type | licenciate | pl |
dspace.entity.type | Publication |