W dniach od 2 kwietnia do 5 kwietnia 2024 r. prowadzone będą prace związane z wdrożeniem nowej wersji systemu Repozytorium UJ. Nie będzie możliwe wprowadzanie nowych informacji do repozytorium. Za utrudnienia przepraszamy.
Empirical modeling of the sodium channel inhibition caused by drugs
pl
dc.type
BookSection
pl
dc.pubinfo
Piscataway : Institute of Electrical and Electronics Engineers
pl
dc.description.physical
293-295
pl
dc.identifier.weblink
http://www.cinc.org/archives/2012/pdf/0293.pdf
pl
dc.abstract.en
The aim of this work was to create extended QSAR model of the relationship between sodium channel blocking activity of the particular compound and its chemical structure together with the in vitro assay conditions. Artificial neural networks (ANNs) were chosen as modeling tools. Chemoinformatics software was used for calculation of the molecular descriptors describing the structure of the interest. Drug concentration causing 50% of the channel inhibition (IC50) was used as the modeling endpoint. The data was based on the literature search and consisted of 38 drugs and 108 records. Initial number of inputs was 110 and during the sensitivity analysis was reduced to 20. ANNs models were optimized in the extended 10-fold cross-validation scheme yielding RMSE = 0.68, NRMSE = 20.7% and R2= 0.35. Best models were ANNs ensembles combining three ANNs with their outputs averaged as a collective output of the system.
pl
dc.subject.en
10-fold cross-validation
pl
dc.subject.en
sodium channel
pl
dc.subject.en
literature search
pl
dc.subject.en
molecular descriptors
pl
dc.subject.en
in-vitro assays
pl
dc.subject.en
empirical modeling
pl
dc.subject.en
drug concentration
pl
dc.subject.en
chemoinformatics
pl
dc.description.series
Computing in Cardiology, ISSN 2325-8861, eISSN 2325-887X; 39
pl
dc.description.conftype
international
pl
dc.identifier.eisbn
978-1-4673-2076-4
pl
dc.title.container
39th Computing in Cardiology Conference (CinC), September 9-12, 2012, Kraków, Poland
pl
dc.language.container
eng
pl
dc.date.accession
2015-02-10
pl
dc.affiliation
Wydział Nauk o Zdrowiu : Instytut Zdrowia Publicznego
pl
dc.affiliation
Wydział Farmaceutyczny : Zakład Farmacji Społecznej
pl
dc.affiliation
Wydział Farmaceutyczny : Zakład Technologii Postaci Leku i Biofarmacji
pl
dc.subtype
ConferenceProceedings
pl
Pliki tej pozycji
Plik
Rozmiar
Format
Przeglądanie
Nie ma plików powiązanych z tą pozycją.
Pozycja umieszczona jest w następujących kolekcjach